Ključna razlika med interferenco RNA in protismiselnim oligonukleotidom je, da je interferenca RNA tehnika, ki vključuje zaporedje specifično supresijo genske ekspresije z dvoverižno RNA, medtem ko je protismiselni oligonukleotid tehnika, ki vključuje zaporedje specifično supresijo izražanja genov z enoverižnim oligonukleotidom DNA.
Utišanje ali supresija genov je način uravnavanja izražanja genov v biološki celici, da se prepreči izražanje določenega gena. Običajno je, ko so geni utišani, njihovo izražanje zmanjšano. Nasprotno, ko so geni izločeni, so popolnoma izbrisani iz genoma organizma; tako ne bo imel izraza. Včasih se utišanje genov šteje za enako kot knockdown genov. To je zato, ker metode za utišanje genov, kot so RNAi, protismiselni oligonukleotid in CRISPR, ki se uporabljajo za utišanje genov, povzročijo zmanjšanje izražanja genov za vsaj 70 %. Interference RNK in protismiselni oligonukleotidi sta dve pomembni tehniki za utišanje genov.
Kaj je interferenca RNA?
Interferenca RNA (RNAi) je biološki proces, v katerem dvoverižne molekule RNA izvajajo zaporedje specifično supresijo izražanja genov. Andrew Fire in Craig C. Mello sta si leta 2006 razdelila Nobelovo nagrado za medicino za njuno izjemno delo na interferenci RNK v črvu nematodi: Caenorhabditis elegans. To pionirsko raziskavo interference RNA so prvič objavili leta 1998. Običajno je pot RNAi v mnogih evkariontskih organizmih, vključno z živalmi.
Slika 01: Interferenca RNA
Dve osrednji molekuli, mikroRNA (miRNA) in majhna interferenčna RNA (siRNA), sta vključeni v pot RNAi. Encim, imenovan Dicer, inducira to pot. Dicer cepi dolgo dvoverižno RNA na kratke dvoverižne fragmente (21 nukleotidov siRNA). Nato se vsaka siRNA odvije v dve enoverižni RNA, znani kot potniška veriga in vodilna veriga. Potniška veriga se degradira, medtem ko je vodilna veriga vključena v RNA inducirani utišalni kompleks (RISC). V RISC vodi pare verig s komplementarno mRNA, ki sproži Argonaute (Ago2), katalitično komponento kompleksa RISC. Kasneje Argonaute cepi molekulo mRNA. Za razliko od siRNA, mikroRNA (miRNA) cilja na 3' neprevedeno regijo mRNA, kjer se vežejo z nepopolno komplementarnostjo. To blokira dostop mRNA do ribosomov za prevajanje.
Kaj je protismiselni oligonukleotid?
Protismiselni oligonukleotid je tehnika, ki vključuje zaporedje specifično supresijo genske ekspresije z oligonukleotidom enoverižne DNA. To tehniko imenujemo tudi protismiselna terapija Je oblika terapije, ki uporablja protismiselne oligonukleotide (ASO) za ciljanje na messenger RNA (mRNA). Protismiselni oligonukleotidi spremenijo ekspresijo mRNA z uporabo različnih mehanizmov, kot je razpad pre mRNA, ki ga posreduje ribonukleaza H, neposredna sterična blokada in modulacija vsebnosti eksona prek vezave mesta spajanja na pre mRNA.
Slika 02: Protismiselni oligonukleotid
Združene države in Evropska unija so odobrile več protismiselnih oligonukleotidov za zdravljenje bolezni. Poleg tega so bili protismiselni oligonukleotidi že odobreni kot terapija za številne bolezni, vključno z Battenovo boleznijo, citomegalovirusnim retinitisom, Duchennovo mišično distrofijo, družinskim sindromom hilomikronemije, družinsko hiperholesterolemijo, dedno amiloidozo, ki jo povzroča transtiretin, in spinalno mišično atrofijo.
Kakšne so podobnosti med interferenco RNA in protismiselnim oligonukleotidom?
- Interferenca RNK in protismiselni oligonukleotid sta dve pomembni tehniki za utišanje genov.
- Obe tehniki ciljata na molekule mRNA.
- So tehnike, specifične za zaporedje.
- Obe tehniki se uporabljata kot terapija za številne bolezni.
- Oba zavirata izražanje genov.
Kakšna je razlika med interferenco RNA in protismiselnim oligonukleotidom?
RNK interferenca je tehnika, ki vključuje zaporedje specifično zatiranje genske ekspresije z dvoverižno RNA, medtem ko je protismiselni oligonukleotid tehnika, ki vključuje zaporedje specifično zatiranje genske ekspresije z enoverižnim DNA oligonukleotidom. To je torej ključna razlika med interferenco RNA in protismiselnim oligonukleotidom.
Spodnja infografika predstavlja razlike med interferenco RNA in protismiselnim oligonukleotidom v obliki tabele za vzporedno primerjavo.
Povzetek – interferenca RNA proti protismiselnemu oligonukleotidu
Tehnike utišanja genov zmanjšajo celično izražanje genov. Interferenca RNK in protismiselni oligonukleotid sta dve pomembni tehniki utišanja genov. Interferenca RNA je tehnika, ki vključuje zaporedje specifično zatiranje genske ekspresije z dvoverižno RNA, medtem ko je protismiselni oligonukleotid tehnika, ki vključuje zaporedje specifično zatiranje genske ekspresije z enoverižnim oligonukleotidom DNA. To torej povzema razliko med interferenco RNA in protismiselnim oligonukleotidom.
