Ključna razlika – minisatelit proti mikrosatelit
Ponavljajoča se DNK so zaporedja nukleotidov, ki se vedno znova ponavljajo v genomu organizmov. Ponavljajoča se DNK predstavlja pomemben del genomske DNK in obstajajo tri glavne vrste, imenovane tandemske ponovitve, končne ponovitve in vmesne ponovitve. Tandemske ponovitve so pogosto ponavljajoča se zaporedja, ki ležijo drug ob drugem brez prekinitev. V genomu vretenčarjev obstajajo tri glavne vrste tandemskih ponovitev. So satelitska DNK, mikrosatelitna DNK in minisatelitna DNK. Minisatelit je del zelo ponavljajoče se DNK, ki je sestavljen iz niza ponavljajočega se zaporedja, sestavljenega iz 10 do 100 baznih parov. Mikrosatelit je del ponavljajoče se DNK, ki je sestavljen iz kratkih ponavljajočih se zaporedij, sestavljenih iz 1 do 9 baznih parov. Zato je ključna razlika med minisatelitom in mikrosatelitom velikost ali dolžina ponavljajočega se zaporedja.
Kaj je minisatelit?
Minisatelitska DNK je del DNK, ki obsega niz kratkega ponavljajočega se zaporedja DNK, katerega dolžina je 10 do 60 baznih parov. Minisateliti se imenujejo tudi tandemska ponavljanja s spremenljivim številom (VNTR). Minisateliti se pogosto zamenjujejo z mikrosateliti. Vendar pa znanstveniki sedaj razlikujejo minisatelite in mikrosatelite glede na velikost ponavljajočega se zaporedja.
Minisatelite je mogoče videti na več kot 1000 mestih v človeškem genomu. Ta kratka zaporedja so bogata z G in C. Število ponovitev v danem minisatelitu se med posamezniki zelo razlikuje.
Prvi človeški minisatelit sta identificirala A. R. Wyman in R. White leta 1980. Kasneje je Alec Jeffreys odkril ekstremni polimorfizem števila kopij minisatelitov med organizmi. Zaradi teh odkritij so bili minisateliti idealni označevalci za prstne odtise DNK, analizo povezav in populacijske študije. Minisateliti prispevajo tudi k regulaciji izražanja genov, transkripcije, alternativnega spajanja itd.
Kaj je mikrosatelit?
Mikrosatelit je del DNK, ki ima enostavna ponavljajoča se zaporedja, dolga od 1 do 10 baznih parov. Mikrosateliti se imenujejo tudi kratke sekvence ponovitev (SSR) ali preproste tandemske ponovitve (STR). Obstajata dve vrsti mikrosatelitov, imenovani preprosti mikrosateliti in sestavljeni mikrosateliti. Preprosti mikrosateliti so sestavljeni iz samo ene vrste ponavljajočih se sekvenc. Sestavljeni mikrosateliti so sestavljeni iz več kot ene vrste ponovitev. Mikrosateliti imajo najpogosteje poli A/T regije. Mikrosateliti so kodominantni in jih je veliko v evkariontskih genomih.
Podobno kot minisateliti tudi mikrosateliti kažejo polimorfizem med posamezniki. Število ponovitev za določen mikrosatelit se razlikuje med posamezniki. Zato se mikrosateliti lahko uporabljajo tudi kot genetski označevalci pri odtisu prstnih odtisov DNK. Mikrosatelitni polimorfizem je mogoče enostavno prepoznati s PCR in gelsko elektroforezo. Bočna regija mikrosatelita je pri sorodnih vrstah zelo ohranjena.
Kakšne so podobnosti med minisatelitom in mikrosatelitom?
- Minisateliti in mikrosateliti so nekodirajoča zaporedja DNK.
- Obe sta tandemski ponovitvi.
- Obe sta sestavljeni iz zelo ponavljajočih se sekvenc.
- Oboje je mogoče uporabiti kot močna genetska označevalca za odvzem prstnih odtisov DNK.
Kakšna je razlika med minisatelitom in mikrosatelitom?
Minisatelit proti mikrosatelitu |
|
| Minisateliti so tandemske ponovitve z dolžino ponovitve monomera od 10 do 100 baznih parov. | Mikrosateliti so kratke tandemske ponovitve, ki so sestavljene iz 1 do 9 baznih parov monomernih ponavljajočih se sekvenc. |
| Velikost ponavljajočega se zaporedja | |
| Minisatelit ima ponavljajoča se zaporedja od 10 do 100 baznih parov. | Mikrosatelit ima kratka zaporedja od 1 do 9 baznih parov. |
| Skupne baze | |
| Minisateliti so bogati z bazami G in C. | Mikrosateliti so bogati z bazami A in T. |
| Druga imena | |
| Minisateliti so znani tudi kot tandemska ponavljanja s spremenljivim številom (VNTR). | Mikrosateliti so znani tudi kot kratka zaporedna ponavljanja (SSR) ali preprosta tandemska ponavljanja (STR). |
Povzetek – minisatelit proti mikrosatelit
Minisatelit in mikrosatelit sta dve vrsti tandemskih ponovitev. Ločimo jih na podlagi števila baz v ponavljajočem se zaporedju ali velikosti zaporedja. Minisatelit ima ponavljajoče se zaporedje dolžine od 10 do 100 baznih parov, medtem ko ima mikrosatelit ponavljajoče se zaporedje dolžine od 1 do 9 baznih parov. To je glavna razlika med minisatelitom in mikrosatelitom. Število kopij ponavljajočega se zaporedja v minisatelitih in mikrosatelitih se med posamezniki zelo razlikuje. Tako minisateliti kot mikrosateliti so močni označevalci DNK za analizo genetskih variacij znotraj in med populacijami vrst.
Prenesite PDF različico Minisatellite vs Microsatellite
Lahko prenesete različico PDF tega članka in jo uporabite za namene brez povezave v skladu z opombami o citatih. Prenesite različico PDF tukaj. Razlika med minisatelitom in mikrosatelitom.
