Ključna razlika med signalnim zaporedjem in signalnim obližem je, da je signalno zaporedje aminokislinsko zaporedje v beljakovinah, ki pomaga spodbuditi celico, da prenese beljakovine v organele ali celično membrano, medtem ko je signalni obliž zaporedje aminokislin v beljakovine, ki pomagajo spodbuditi celico, da premesti beljakovine iz citosola v jedro.
Usmerjanje ali razvrščanje beljakovin je biološki mehanizem, s katerim se beljakovine prenašajo na ustrezne lokacije znotraj ali zunaj celice. Informacije, ki jih vsebuje sam protein, usmerjajo ta proces dostave. Pravilno razvrščanje beljakovin je ključnega pomena za celico. Napake ali motnje pri razvrščanju lahko povzročijo številne bolezni. Signalno zaporedje in signalni obliž sta dve zaporedji, sestavljeni iz aminokislin v beljakovinah, ki sodelujeta pri ciljanju ali razvrščanju beljakovin.
Kaj je zaporedje signalov?
Signalno zaporedje je zaporedje aminokislin v proteinih, ki spodbudi celico, da premesti proteine, običajno v organele ali celično membrano. Signalno zaporedje je znano tudi kot signalni peptid. Je kratek peptid, ki vsebuje od 16 do 30 aminokislin. Prisoten je na koncu N (občasno na koncu C) večine na novo sintetiziranih proteinov. Signalno zaporedje pomaga beljakovinam pri sekrecijskih poteh. Beljakovine, ki vsebujejo signalne sekvence, vključujejo tiste, ki se nahajajo znotraj organelov (endoplazemski retikulum, Golgijev aparat ali endosomi), izločene iz celice ali vstavljene v večino celičnih membran.
Slika 01: Zaporedje signalov
Običajno ima večina membransko vezanih proteinov tipa I signalne sekvence. Vendar pa je večina proteinov tipa II in večrazponskih membransko vezanih proteinov usmerjena na sekretorno pot s svojo prvo transmembransko domeno, znano kot "tarčni peptid". Poleg tega pri prokariontih signalne sekvence usmerjajo novo sintetizirane proteine v prevodni kanal proteina SecYEG, ki je prisoten v plazemski membrani. Poleg tega v evkariontih obstaja homologni sistem, kjer signalne sekvence usmerjajo na novo sintetizirane proteine v kanal Sec61. Čeprav ima ta kanal strukturno in zaporedno homologijo s SecYEG, je prisoten v endoplazmatskem retikulumu.
Kaj je signalni popravek?
Signalni obliž je aminokislinsko zaporedje v proteinih, ki spodbudi celico, da prenese proteine iz citosola v jedro. Signalni obliž vsebuje informacije za pošiljanje danega proteina na označeno mesto v celici. Najverjetneje signalna pot usmerja protein iz citosola v jedro. Sestavljen je iz aminokislinskih ostankov, ki so v primarnem zaporedju oddaljeni drug od drugega. Vendar se te aminokisline nahajajo blizu druga drugi v terciarni strukturi zvitega proteina.
Slika 02: Zaplata signala
Za razliko od signalnih zaporedij se signalne zaplate po procesu sortiranja ne odcepijo od zrelega proteina. Signalne zaplate je zelo težko predvideti. Signali za jedrsko lokalizacijo so na splošno signalni zaplati, čeprav obstajajo tudi nekatera signalna zaporedja. Poleg tega se na beljakovinah, namenjenih jedru, nahajajo signalne lise, ki omogočajo njihov selektivni transport iz citosola v jedro skozi komplekse jedrnih por.
Kakšne so podobnosti med zaporedjem signala in zaplato signala?
- Signalno zaporedje in signalni obliž sta dve zaporedji, ki sodelujeta pri ciljanju ali razvrščanju beljakovin.
- Obe zaporedji sta prisotni znotraj beljakovin.
- Ta zaporedja so kratka zaporedja aminokislin.
- Napake v obeh zaporedjih lahko povzročijo disfunkcijo pri razvrščanju beljakovin, kar povzroči številne bolezni.
Kakšna je razlika med zaporedjem signala in zaplato signala?
Signalno zaporedje je aminokislinsko zaporedje, ki ga najdemo v proteinih in spodbudi celico, da premesti proteine v organele ali celično membrano, medtem ko je signalni obliž aminokislinsko zaporedje, ki ga najdemo v proteinih in spodbudi celico za prenos beljakovin običajno iz citosola v jedro. To je torej ključna razlika med signalnim zaporedjem in signalnim popravkom. Poleg tega signalno zaporedje po sortiranju razcepijo zreli proteini, medtem ko zreli proteini po sortiranju ne razcepijo signalnega obliža.
Naslednja tabela povzema razlike med zaporedjem signala in zaplato signala.
Povzetek – Zaporedje signala v primerjavi s popravkom signala
Signalno zaporedje in signalni obliž sta dve zaporedji, ki ju najdemo v beljakovinah. Potrebni so za ciljanje ali razvrščanje beljakovin. Signalno zaporedje spodbudi celico, da premesti proteine, običajno v organele ali celično membrano. Po drugi strani pa signalni obliž spodbudi celico, da premesti beljakovine, običajno iz citosola v jedro. Torej, to je ključna razlika med zaporedjem signala in popravkom signala.
