Ključna razlika med Cosmidom in Phagemidom je v vrsti zaporedij, ki jih vsebuje. Kozmid vsebuje mesto cos in plazmid. Zato je hibridni vektor, medtem ko je Phagemid plazmid, ki vsebuje F1 izvor replikacije faga F1.
Kozmidi in fagemidi se uporabljajo za namene kloniranja, zlasti za kloniranje večjih fragmentov DNK. Ti se pogosto uporabljajo predvsem pri kloniranju genov, odgovornih za proizvodnjo različnih beljakovin. Kozmidi in fagemidi se replicirajo sami kot plazmidi ali pa se pakirajo v virusne delce in nato replicirajo.
Kaj je Cosmid?
Kozmid, imenovan hibridni plazmid, obsega mesta cos, ekstrahirana iz delcev faga Lambda, in plazmid. Ta cos mesta so dolgi fragmenti DNK z 200 baznimi pari. Zato imajo kohezivne ali lepljive konce, ki omogočajo, da se plazmid prilega virusni DNK. Zato so mesta cos ključna za pakiranje DNK.
Obstajajo tri spletna mesta cos;
- mesto cosN – sodeluje pri rezanju verige DNK z aktivnostjo terminaze
- cosB stran – ukvarja se z zadrževanjem terminase.
- mesto cosQ – sodeluje pri preprečevanju razgradnje DNK z DNK-azami.
Slika 01: Kozmid
Poleg tega lahko kozmidi podvojijo enoverižno DNK ali dvoverižno DNK z uporabo ustreznega izvora replikacije. Kozmidi običajno vsebujejo gene za odpornost na antibiotike kot markerje za selekcijo transformantov. Tako lahko uporaba kozmida kot vektorja olajša kloniranje, prebava vektorja z restrikcijskim encimom pa lahko nato ekstrahira te fragmente.
Kaj je Phagemid (Phasmid)?
Phagemid, imenovan tudi Phasmid, je tudi vrsta hibridnega vektorja. Phagemid vsebuje poseben izvor replikacije, imenovan kot f1 izvor replikacije. Izvor replikacije f1 izvira iz faga f1.
Phagemid lahko posnema tako enoverižno kot dvoverižno DNA. Replikacija lahko poteka kot plazmid med neodvisno replikacijo ali pa se lahko zapakira v delce faga in končno okuži bakterijski gostitelj E coli. Pri okužbi celic E coli fag f1 zahteva prisotnost pilusa. Zato so spolni pili pomembni med in vitro pakiranjem Phagemidov.
Kakšne so podobnosti med Cosmidom in Phagemidom?
- Tako Cosmid kot Phagemid sta vektorja za kloniranje, ki se uporabljata v tehnologiji rekombinantne DNA.
- Cosmid in Phagemid lahko replicirata enoverižno in dvoverižno DNK.
- Oba sta lahko podvržena neodvisni replikaciji, podobno kot plazmidi.
- Cosmid in Phagemid sta lahko podvržena pakiranju in vitro in okužita bakterijske celice.
- Tako Cosmid kot Phagemid zahtevata ustrezen izvor replikacije za kloniranje.
Kakšna je razlika med Cosmidom in Phagemidom?
Cosmid proti Phagemidu |
|
| Kozmid je hibridni vektor, ki vsebuje mesto cos in plazmid. | Fagemid je plazmid, ki vsebuje F1 izvor replikacije faga F1. |
| Prisotnost spletnih mest Cos | |
| Ker so mesta prisotna v kozmidu in so potrebna za pakiranje in vitro. | Ker v phagemidu ni spletnih mest. |
| Prisotnost izvora replikacije F1 | |
| V kozmidu je fi izvor replikacije lahko prisoten ali pa tudi ne. | F1 izvor replikacije je prisoten v fagemidu. |
| Prisotnost genov, odpornih na antibiotike | |
| Geni, odporni na antibiotike, so prisotni v kozmidih za identifikacijo transformantov od netransformantov. | Geni, odporni na antibiotike, v fagemidih niso prisotni. |
| Zahteva za pakiranje in vitro | |
| Potrebno je spletno mesto cos. | Potreben je spolni pilus. |
Povzetek – Cosmid proti Phagemidu
Cosmid in Phagemid sta vektorja za kloniranje, ki se uporabljata v tehnologiji rekombinantne DNK. Kozmidi so hibridni vektorji, ki vsebujejo posebne lepljive konce, znane kot cos mesta. embalaža in vitro zahteva ta mesta cos. Medtem ko so fagemidi plazmidi, ki vsebujejo izvor replikacije f1, ekstrahiran iz faga f1. Tako kozmid kot fagemid sta lahko podvržena neodvisni replikaciji ali in vitro pakiranju v bakterijske celice. To so pomembne razlike med kozmidom in fagemidom.
