Ključna razlika – ponavljajoča se DNK v primerjavi s satelitsko DNK
Genomska DNK je v glavnem sestavljena iz kodirne in nekodirajoče DNK. Kodirne sekvence so znane kot geni. Na tisoče genov se nahaja na kromosomih. Ponavljajoča se DNK, introni in regulatorna zaporedja se štejejo za nekodirajočo DNK v genomu. Ponavljajoča se DNK so nukleotidna zaporedja, ki se vedno znova ponavljajo v genomu organizmov. Ponavljajoča se DNK predstavlja pomemben del genomske DNK in je razvrščena v tri glavne vrste, imenovane tandemske ponovitve, končne ponovitve in vmesne ponovitve. Tandemske ponovitve se v genomu zelo ponavljajo. Ena vrsta tandemskih ponovitev je satelitska DNK. Ključna razlika med ponavljajočo se DNK in satelitsko DNK je v tem, da so ponavljajoče se DNK ponavljajoče se sekvence DNK v genomu, medtem ko je satelitska DNK vrsta ponavljajoče se DNK, ki se zelo ponavlja in se nahaja večinoma v heterokromatskem območju okoli centromere.
Kaj je ponavljajoča se DNK?
Ponavljajoča se DNK vedno znova ponavlja zaporedja nukleotidov. Ponavljajoča se DNK je znana tudi kot ponavljajoči se elementi ali ponovitve. Ponavljajoča se DNK zavzema pomemben del celotnega genoma mnogih organizmov. Človeški genom vsebuje več kot dve tretjini zaporedja ponavljajoče se DNK. Ti ne kodirajo beljakovin in spadajo v kategorijo nekodirajoče DNK genoma.
Obstajajo tri glavne vrste ponavljajoče se DNK, imenovane terminalna ponavljanja, tandemska ponavljanja in vmesna ponavljanja. Tandemske ponovitve so pogosto ponavljajoča se zaporedja, ki ležijo ena poleg druge. Obstajajo tri vrste tandemskih ponovitev, imenovane satelitska DNK, minisatelitna DNK in mikrosatelitna DNK. Razpršena ponavljajoča se DNK je ponavljajoče se zaporedje, razpršeno po celotnem genomu kot posamezne enote z edinstvenimi bočnimi zaporedji. Obstajata dve vrsti razpršene DNK, imenovani transpozoni in retrotranspozoni. Nastanejo zaradi sposobnosti transpozicije znotraj genoma. Retrotranspozoni spadajo v prenosljive elemente razreda 1 in sledijo mehanizmu kopiranja in lepljenja za integracijo v genom. Transpozoni spadajo v prenosljive elemente razreda 2, saj sledijo mehanizmu izreži in prilepi za premikanje po genomu.
Čeprav ponavljajoča se DNK ni kodirana za beljakovine, so pomembne za različne funkcije v genomu. Ponavljajoča se DNK je bistvenega pomena za oblikovanje izražanja edinstvenih kodirnih zaporedij in zagotavljanje dodatnih funkcij, potrebnih za replikacijo genoma in natančen prenos v hčerinske celice itd. Ponavljajoča se DNK zagotavlja tudi znaten del področij ali matričnih pritrdilnih regij, kar kaže na njeno nujnost pri organiziranju genoma organizmov.
Kaj je satelitska DNK?
Satelitska DNK je vrsta ponavljajoče se DNK, ki se pogosto ponavlja. Spadajo v kategorijo ponavljajoče se DNK, imenovane tandemske ponovitve. Satelitska DNK se tandemsko ponavlja in se nahaja v regijah centromer in telomer kromosomov. Ena kratka ponavljajoča se enota satelitske DNK obsega od 5 do 300 baznih parov, odvisno od vrste. V genomu se običajno ponovijo 105 do 106-krat. V genomu sesalcev predstavlja delež satelitske DNK 10 – 20 %.
Satelitska DNK ne kodira beljakovin in ne prenaša funkcionalnih genetskih informacij. Prispevajo h kromosomski organizaciji, saj služijo kot glavna komponenta funkcionalnih centromer in kot glavna strukturna sestavina heterokromatina.
Satelitska DNK se razlikuje po gostoti z večino DNK. Zato daje ločen pas med ultracentrifugiranjem. Obstajajo različne vrste satelitske DNK, znane kot alfoidna DNK, beta, satelit 1, satelit 2, satelit 3 itd.
Slika 01: Ponavljajoča se DNK in satelitska DNK
Kakšna je razlika med ponavljajočo se DNK in satelitsko DNK?
Ponavljajoča se DNK proti satelitski DNK |
|
| Ponavljajoča se DNK so nukleotidna zaporedja, ki se večkrat ponovijo v genomu organizmov. | Satelitska DNK je ena vrsta ponavljajoče se DNK, ki se v genomu ponovi milijonkrat. |
| Vrste | |
| Obstajajo tri glavne vrste, kot so terminalna ponavljanja, tandemska ponavljanja in vmesna ponavljanja. | Satelitski DNK je razvrščen v različne vrste, kot so alfoid, beta, saterlit 1, 2 in 3 itd. |
| Lokacija | |
| Ponavljajoča se DNK se nahaja v celotnem genomu. | Satelitska DNK se nahaja v regijah centromere in telomere kromosoma. |
Povzetek – ponavljajoča se DNK proti satelitski DNK
Genomi so organizirani v različne vrste DNK. Kodirne sekvence med njimi so shranjene z genetskimi informacijami za sintezo beljakovin. Druga nekodirajoča zaporedja zagotavljajo strukturne in dodatne funkcije za replikacijo DNK, vzdrževanje kromosomske strukture itd. Ponavljajoča se DNK je vrsta nekodirajoče DNK, ki se vedno znova ponavlja v genomu. Ponavljajoče se DNK imajo različne vrste in satelitska DNK, ki se nahaja v regijah centromer in telomer kromosomov, je ena izmed njih. To je razlika med ponavljajočo se DNK in satelitsko DNK.
Prenesite PDF različico ponavljajoče se DNK proti satelitski DNK
Lahko prenesete različico PDF tega članka in jo uporabite za namene brez povezave v skladu z opombami o citatih. Prenesite PDF različico tukaj Razlika med ponavljajočo se DNK in satelitsko DNK – PDF.
