Ključna razlika med profiliranjem DNK in sekvenciranjem DNK je, da je profiliranje DNK metoda, ki se uporablja za identifikacijo posameznika iz vzorca z opazovanjem edinstvenih vzorcev v DNK, medtem ko je sekvenciranje DNK metoda, ki se uporablja za določanje zaporedja nukleotidov v delčku DNK posameznika.
Tehnologije, kot sta profiliranje DNK in sekvenciranje DNK, so zelo koristne pri določanju vzorca dedovanja v populaciji. Čeprav profiliranje DNK in sekvenciranje DNK vključujeta nekatere iste tehnike, je končni cilj vsakega od njih drugačen. Zato profiliranje DNK pokaže genetsko zasnovo posameznika. Nasprotno pa sekvenciranje DNK določa genom in proteine, ki jih posameznik kodira.
Kaj je profiliranje DNK?
Profiliranje DNK je metoda, ki se uporablja za identifikacijo posameznika iz vzorca z opazovanjem edinstvenih vzorcev v DNK. To tehniko je leta 1984 prvič odkril profesor Sir Alec Jeffreys. Profiliranje DNK zazna veliko minisatelitov v genomu, da ustvari vzorec, edinstven za posameznika. To se imenuje prstni odtis DNK. Verjetnost, da bi imeli dve osebi enak prstni odtis DNK, je zelo redka. Zato je tako kot dejanski prstni odtis tudi prstni odtis DNK edinstven za posameznika. Profiliranje DNK običajno vključuje vzorčenje DNK in njegovo primerjavo z vzorcem, najdenim na kraju zločina.
Slika 01: Profiliranje DNK
Pri profiliranju DNK se DNK najprej ekstrahira iz človeškega materiala. Nato se restrikcijski encimi uporabijo za rezanje DNK. Nato se nastali deli velikosti DNK ločijo z gelsko elektroforezo. Ko so deli DNK razvrščeni v gelu, se bodo prenesli na najlonsko membrano, da se proizvedejo posamezne verige DNK. Najlonsko membrano inkubiramo z radioaktivnimi sondami. Sonde so minisateliti. Pritrdijo se le na dele DNK, ki so komplementarni. Nazadnje, minisatelite v vzorcu DNK, ki ga pritrdijo sonde, je mogoče vizualizirati z uporabo rentgenskih filmov. Poleg tega je ta vzorec DNK prstni odtis DNK, ki je edinstven za posameznika.
Kaj je sekvenciranje DNK?
Sekvenciranje DNK je metoda, ki se uporablja za določanje zaporedja nukleotidov v delu DNK posameznika. Znano je tudi kot določanje vrstnega reda nukleotidov v DNK. Pojav različnih metod sekvenciranja DNK je izjemno pospešil biološke in medicinske raziskave. Uporablja se za številna področja, kot so medicinska diagnoza, biotehnologija, forenzična biologija, virologija in bioinformatika. S primerjavo zaporedij DNK zdravih in mutiranih vzorcev je mogoče diagnosticirati različne bolezni, kot je rak.
Slika 02: Sekvenciranje DNK
Sekvenciranje DNK je prvi identificiral Frederick Sanger v sedemdesetih letih prejšnjega stoletja. Pri Sangerjevem sekvenciranju se ciljna DNK večkrat kopira z izdelavo fragmentov različnih dolžin. Na koncu Sangerjevega sekvenciranja bo epruveta vsebovala različne dolžine fragmentov, ki se končajo na vsakem položaju nukleotida v izvirni DNK. Pri tej tehniki nukleotidi terminatorja florescentne verige označujejo konce fragmentov. Omogočajo tudi določitev zaporedja. Tako je mogoče iz barv barvil, ki se bodo ena za drugo zapisovala na detektorju, sestaviti zaporedje originalne DNK.
V zadnjih nekaj letih so se razvile različne nove tehnike sekvenciranja DNK, kot je sekvenciranje naslednje generacije. Sekvenciranje naslednje generacije je obsežen pristop, ki poveča hitrost sekvenciranja DNK. Prav tako zmanjša stroške sekvenciranja DNK.
Kakšne so podobnosti med profiliranjem DNK in sekvenciranjem DNK?
- Profiliranje DNK in sekvenciranje DNK sta tehniki molekularne biologije.
- Oba temeljita na DNK.
- Oba uporabljata PCR in elektroforezo v gelu.
- Te tehnike so zelo pomembne za prepoznavanje genoma posameznika.
- Obe tehniki imata široko uporabo v forenzični znanosti.
- Poleg tega jih je mogoče uporabiti pri testiranju očetovstva.
Kakšna je razlika med profiliranjem DNK in sekvenciranjem DNK?
Profiliranje DNK je metoda, ki se uporablja za identifikacijo posameznika iz vzorca z opazovanjem edinstvenih vzorcev v DNK. Po drugi strani pa je sekvenciranje DNK metoda, ki se uporablja za določanje zaporedja nukleotidov v delu DNK posameznika. Torej, to je ključna razlika med profiliranjem DNK in sekvenciranjem DNK. Poleg tega je cilj profiliranja DNK odkriti variacije v človeški DNK v obliki minisatelitov. Nasprotno pa je cilj sekvenciranja DNK določiti zaporedje nukleotidov, ki sestavljajo molekulo DNK.
Naslednja infografika prikazuje razlike med profiliranjem DNK in sekvenciranjem DNK v obliki tabele.
Povzetek – Profiliranje DNK v primerjavi s sekvenciranjem DNK
Profiliranje DNK in sekvenciranje DNK sta dve glavni molekularni biološki tehniki. Imajo široko uporabo v forenzični znanosti, medicinski diagnostiki, biotehnologiji, virologiji in biosistematiki. Profiliranje DNK se uporablja za identifikacijo posameznika iz vzorca z opazovanjem edinstvenih vzorcev v DNK, medtem ko se sekvenciranje DNK uporablja za določitev zaporedja nukleotidov v delu DNK posameznika. To je torej povzetek razlike med profiliranjem DNK in sekvenciranjem DNK.
