Ključna razlika med Rho odvisno in Rho neodvisno terminacijo je, da se pri Rho odvisni terminaciji Rho faktor veže na transkript in konča transkripcijo tako, da prekine vodikove vezi med šablono in transkriptom, medtem ko Rho neodvisna terminacija konča transkripcijo z ustvarja strukturo lasne zanke in nato U bogato regijo v prepisu.
Transkripcija je ena od dveh stopenj izražanja genov. To je proces, ki proizvede zaporedje mRNA iz genetske informacije, skrite v zaporedju DNK gena. Transkripcija poteka v treh korakih: iniciacija, elongacija in terminacija. Encim RNA polimeraza se veže na promotorsko sekvenco gena in začne katalizirati sintezo verige RNA. Dokler ni najdeno terminatorsko zaporedje, polimeraza RNK dodaja nukleotide in gradi verigo RNK. Pri prokariontih se terminacija zgodi z dvema glavnima terminacijskima strategijama: Rho odvisna terminacija in Rho neodvisna terminacija. Rho faktor je protein, ki ima helikazno aktivnost.
Kaj je Rho odvisna prekinitev?
Rho odvisna terminacija je ena od dveh vrst strategije terminacije transkripcije, ki se pojavlja pri prokariontih. Rho faktor je protein, ki ima helikazno aktivnost.
Slika 01: Odvisna prekinitev Rho
Rho protein se veže na zapis RNA in se premika vzdolž RNA polimeraze v smeri 5’-3’, kar spodbuja disociacijo vodikovih vezi med predlogo DNA in zapisom RNA. Ko faktor Rho doseže transkripcijski mehurček, potegne hibrid DNA/RNA narazen in sprosti prepis iz transkripcijskega mehurčka. Ko se to zgodi, prekine prepis.
Kaj je Rho Independent Termination?
Rho neodvisna prekinitev je druga strategija, ki prekine prokariontsko transkripcijo. Običajno ima terminatorsko območje obrnjeno ponavljajoče se zaporedje. Takoj za obrnjenim ponavljajočim se zaporedjem je območje, bogato z adeninom (AAAA). Ko se RNA polimeraza premakne naprej, proizvede zaporedje mRNA. Ker sta dve regiji komplementarni v regiji obrnjenega ponovljenega zaporedja, tvori strukturo lasne zanke zaradi vodikove vezi. Naslednja regija bo U bogata regija. Struktura lasnice prekine aktivnost RNA polimeraze.
Slika 02: Neodvisna prekinitev Rho
Poleg tega so v regijah, bogatih z U, šibke interakcije med U bazami prepisa in A bazami predloge. Te šibke adenin-uracilne vezi destabilizirajo predlogo DNK in zapis RNK ter se med seboj ločijo. Na koncu se prepis osvobodi mesta prepisa.
Kakšne so podobnosti med Rho odvisno in Rho neodvisno odpovedjo?
- Rho odvisna in Rho neodvisna terminacija sta dve glavni strategiji terminacije, ki ju najdemo pri prokariontih.
- Obe obliki sprostita prepis iz predloge DNK, da prekineta prepis.
Kakšna je razlika med Rho odvisno in Rho neodvisno odpovedjo?
Rho odvisno prekinitev posreduje Rho protein, medtem ko se Rho neodvisna prekinitev pojavi s tvorbo lasne zanke. Torej, to je ključna razlika med Rho odvisnim in Rho neodvisnim zaključkom. Poleg tega beljakovina Rho uporablja energijo ATP, medtem ko neodvisna prekinitev Rho ne vključuje beljakovine Rho in ne uporablja energije ATP. Zato je to tudi pomembna razlika med Rho odvisnim in Rho neodvisnim zaključkom.
Spodnja infografika prikazuje več primerjav, povezanih z razliko med Rho odvisnim in Rho neodvisnim zaključkom.
Povzetek – Odvisna od Rho proti Rho Neodvisna prekinitev
Rho odvisna in Rho neodvisna terminacija sta dva glavna mehanizma terminacije transkripcije, ki se pojavljata pri prokariontih. Protein Rho je odgovoren za terminacijo transkripcije pri Rho odvisni terminaciji. V nasprotju s tem se Rho neodvisna prekinitev pojavi s tvorbo strukture lasne zanke. Torej, to je ključna razlika med Rho odvisnim in Rho neodvisnim zaključkom.
