Ključna razlika med TATA in CAAT poljem je, da je TATA polje ohranjeno nukleotidno območje, ki ima konsenzno zaporedje TATAWAW, medtem ko je CAAT polje ohranjeno nukleotidno območje s soglasnim zaporedjem GGCCAATCT.
TATA box in CAAT box sta dve regiji nukleotidov, ki vplivata na transkripcijo evkariontskih genov. So nekodirajoče sekvence DNK, ki jih najdemo pred mestom iniciacije transkripcije. Pravzaprav jih najdemo v regulativni regiji, ki je znana kot promotor. Za učinkovitost transkripcije sta odgovorna tako TATA kot CAAT box. So konsenzna zaporedja, ki se skozi evolucijski proces niso spremenila.
Kaj je TATA Box?
TATA škatla ali Goldberg-Hognessova škatla je konsenzno zaporedje, ki ga najdemo v promotorski regiji evkariontskih genov. TATA box je osrednji element promotorja. Nahaja se 25 baznih parov navzgor od mesta iniciacije transkripcije. Ohranja se skozi ves evolucijski proces. Soglasno zaporedje polja TATA je TATAWAW, kjer je W A ali T. To je nekodirajoče zaporedje DNK. Vendar pa je TATA box pomemben za transkripcijo gena. Je vezavno mesto TATA-vezavnega proteina (TBP) in drugih transkripcijskih faktorjev. Ko se vežejo v škatlo TATA, pride do rekrutiranja RNA polimeraze II in pravilne regulacije transkripcije v evkariontskih genih.
Slika 01: TATA Box
Ker je TATA box vključen v regulacijo transkripcije, lahko mutacije TATA boxa povzročijo fenotipske spremembe, ki vodijo do bolezni, kot so rak želodca, spinocerebelarna ataksija, Huntingtonova bolezen, slepota, β-talasemija, imunosupresija, Gilbertov sindrom, in HIV-1 itd.
Kaj je CAAT Box?
CAAT polje je regija nukleotidov s konsenznim zaporedjem GGCCAATCT. Podobno kot TATA box se tudi CAAT box nahaja v promotorski regiji gena. Zato se nahaja približno 75-80 baznih parov navzgor od transkripcijskega mesta.
Slika 02: CAAT Box
Specifični transkripcijski faktorji se vežejo na polje CAAT. Ta vezava stabilizira preiniciacijski kompleks za lažjo vezavo encima RNA polimeraze. Podobno polje CAAT deluje kot regulativno zaporedje. Mutacije v regiji CAAT box močno vplivajo na odziv promotorja in regulacijo transkripcije.
Kakšne so podobnosti med TATA in CAAT Boxom?
- TATA in CAAT sta dve regiji nukleotidov, ki ju najdemo v regulativnem zaporedju evkariontskih genov.
- Najdemo jih navzgor do mesta iniciacije transkripcije.
- Obe sta soglasni zaporedji DNK.
- Bistvenega pomena so za regulacijo transkripcije, zato so regulatorna zaporedja.
Kakšna je razlika med TATA in CAAT Boxom?
TATA box je ohranjena nukleotidna regija, ki jo najdemo približno 25-30 baznih parov navzgor od mesta iniciacije transkripcije. Po drugi strani pa je škatla CAAT ohranjena regija nukleotidov, najdenih približno 75–80 baznih parov navzgor od mesta iniciacije transkripcije. Torej, to je ključna razlika med škatlo TATA in CAAT. Poleg tega ima polje TATA soglasno zaporedje TATAWAW, medtem ko je GGCCAATCT soglasno zaporedje polja CAAT.
Poleg tega je druga pomembna razlika med TATA in CAAT boxom ta, da TATA box zagotavlja vezavno mesto za TBP in transkripcijske faktorje ter sodeluje pri regulaciji transkripcije, medtem ko CAAT box signalizira vezavno mesto za transkripcijski faktor RNA.
Spodnja infografika povzema razlike med škatlama TATA in CAAT.
Povzetek – TATA proti CAAT Box
TATA box in CAAT box sta dva dela ohranjene regije promotorjev evkariontskih genov. Nahajajo se pred mestom iniciacije transkripcije. Oba vplivata na transkripcijo genov z zagotavljanjem mest za vezavo TATA-vezavnih proteinov in faktorjev iniciacije transkripcije. Škatla TATA se nahaja 25-35 baznih parov navzgor od mesta iniciacije transkripcije, medtem ko se škatla CAAT nahaja 75-80 baznih parov navzgor od mesta iniciacije transkripcije. Soglasno zaporedje polja TATA je TATAWAW, medtem ko je soglasno zaporedje polja CAAT GGCCAATCT. To je torej povzetek razlike med škatlama TATA in CAAT.
