Ključna razlika – evkariontski proti prokariontskim promotorjem
Transkripcija je proces pretvorbe genetske informacije, shranjene v kodirnem zaporedju DNA, v zaporedje mRNA. Specifična regija DNA, ki se nahaja na 5' koncu transkripcijske enote, sproži ta proces. Ta regija je znana kot promocijska regija. Ti promotorji se običajno nahajajo poleg mesta začetka transkripcije. Dolžina promotorja se spreminja od 100 bp do 1000 bp. Promotorji se razlikujejo glede na vrsto organizma. Evkariontski in prokariontski promotorji se med seboj razlikujejo. Pri prokariontih najdemo samo tri vrste promotorskih sekvenc, in sicer -10 promotorje, -35 promotorje in gorvodne elemente. V evkariontih je veliko različnih promotorskih elementov, kot so TATA box, iniciatorski elementi, GC box, CAAT box itd. To je ključna razlika med evkariontskimi in prokariontskimi promotorji.
Kaj so evkariontski promotorji?
Tri glavne porcije; jedrni promotor, proksimalni promotor in distalni promotor skupaj tvorijo promotor. V kontekstu evkariontov je najdenih veliko število promotorskih elementov, ki so zelo sofisticirani in bolj raznoliki kot promotorji. Ugotovljeno je bilo, da ima DNK zaradi te kompleksnosti evkariontskih promotorjev sposobnost, da se sama zvije. To tudi pojasnjuje dejstvo, da se učinek številnih regulatornih zaporedij pojavi, čeprav se nahajajo veliko kilobaz stran od mesta transkripcije. Ti evkariontski promotorji imajo sposobnost, da se raztezajo skozi širok spekter zaporedij DNK.
Slika 01: Evkariontski promotor
Primeri za nekatere evkariontske promotorje so Pribnow box (TATA box), GC box, CAAT box itd. V kontekstu TATA boxa je zaporedje 5' – TATAA -3' prisotno v jedru promotorsko regijo. Na polje TATA so vezani proteini transkripcijskega faktorja in histonski proteini. Vezava proteinov transkripcijskega faktorja na škatlo TATA pomaga pri vezavi RNA polimeraze, kar nato povzroči nastanek transkripcijskega kompleksa. Preprosto povedano, vezava teh proteinov bo vodila proces prepisovanja. Ta proces bo oviran, ko se histonski proteini vežejo na polje TATA. Zato je polje TATA pomemben promotorski element, ki vključuje uravnavanje hitrosti evkariontske transkripcije.
Kaj so prokariontski promotorji?
V prokariontskih organizmih je promotor, ki sodeluje pri transkripciji, identificiran s povezanim faktorjem, imenovanim sigma faktor. Sigma faktorji so edinstveni za različne promotorske sekvence. Zato je rečeno, da bi vsak posamezen sigma faktor prepoznal eno jedrno promotorsko sekvenco. To je edinstvena lastnost, ki je prisotna v procesu prokariontske transkripcije. Polimeraza RNA in faktor sigma skupaj identificirata pravo promotorsko regijo in tvorita transkripcijski kompleks.
Prokariontski promotor vsebuje samo tri vrste promotorskih elementov. Manjša vpletenost promotorskih elementov v prokarionte je glavni razlog, zakaj je njihov transkripcijski proces manj sofisticiran v primerjavi z evkariontsko transkripcijo, ki vključuje večje število promotorskih zaporedij. Od treh promotorskih elementov prokariontov sta dve glavni pomembni dve kratki zaporedji DNA. Ta zaporedja so razvrščena glede na njihovo lokacijo. To so -10 promotorji ali element (ki je prisoten 10 bp pred mestom začetka transkripcije), -35 promotorji ali element (ki je prisoten 35 bp pred mestom začetka transkripcije).
Slika 02: Prokariontski promotor
Promotor -10 je enakovreden evkariontskemu TATA boxu ali Pribnow boxu in je bistvena komponenta za začetek transkripcije v prokariontih. Promotor -35 je sestavljen iz zaporedja, ki je TTGACA, ki aktivno sodeluje pri uravnavanju hitrosti prokariontske transkripcije.
Kakšne so podobnosti med evkariontskimi in prokariontskimi promotorji?
- Pri obeh vrstah so promotorji pod nadzorom različnih regulacijskih sekvenc DNK, ki vključujejo ojačevalce, dušilce zvoka, izolatorje in mejne elemente.
- Promotorji so zaporedja, ki sprožijo transkripcijo pri prokariontih in evkariontih.
- Promotorji so zaporedja DNK.
Kakšna je razlika med evkariontskimi in prokariontskimi promotorji?
Evkariontski proti prokariontskim promotorjem |
|
| Evkariontski promotorji so regulatorna zaporedja, ki sprožijo prepisovanje evkariontskih organizmov. | Prokariontski promotorji so regulatorna zaporedja, ki sprožijo transkripcijo prokariontskih genov. |
| Elementi | |
| Prokariontski promotor je sestavljen iz zgornjih elementov, -10 elementa in -35 elementov. | Evkariontski promotor je sestavljen iz Pribnow boxa (TATA box), CAAT boxa, GC boxa in iniciatorskih elementov. |
Povzetek – evkariontski proti prokariontskim promotorjem
Promotor je regija DNK, ki vključuje začetek procesa, imenovanega transkripcija. Ti promotorji se običajno nahajajo pred mestom začetka transkripcije. Trije glavni deli, ki tvorijo promotor, so jedrni promotor, proksimalni promotor in distalni promotor. V kontekstu evkariontov obstaja veliko število pospeševalnih elementov v promotorski regiji, ki so zelo sofisticirani in bolj raznoliki kot prokarionti. Primeri nekaterih evkariontskih promotorskih elementov so Pribnow box (TATA box), GC box, CAAT box itd. Pri prokariontih sta dva glavna pomembna promotorska elementa, in sicer element -10 (ki je prisoten 10 bp pred začetnim mestom transkripcije), -35 element (ki je prisoten 35 bp pred začetnim mestom transkripcije). Promotor -10 začne transkripcijo, promotor -35 pa uravnava transkripcijo. Obe vrsti promotorjev nadzirajo različne regulacijske sekvence DNK, ki vključujejo ojačevalce, dušilce zvoka, izolatorje in mejne elemente. To je razlika med evkariontskimi in prokariontskimi promotorji.
Prenesite PDF Eukaryotic vs Prokariotic Promoters
Različico PDF tega članka lahko prenesete in jo uporabite za namene brez povezave v skladu z opombo o citiranju. Prenesite PDF različico tukaj: Razlika med evkariontskim in prokariontskim promotorjem
