Ključna razlika med protomeri in kapsomeri je v tem, da so protomeri strukturne enote oligomernih proteinov, medtem ko so kapsomeri posamezni proteini, sestavljeni iz protomerov, ki so strukturne podenote virusne kapside.
Virus je znotrajcelični obligatni parazit, ki je nalezljiv delec. Kapsida je ena od dveh glavnih komponent virusnega delca. Je beljakovinski ovoj, ki obdaja in ščiti virusni genom. Kapsida je sestavljena iz protomerov, ki so strukturne enote oligomernih proteinov. Kapsomera je strukturna podenota virusne kapside in je agregacija več protomerov kot enote. Tako se protomeri sami sestavijo, da tvorijo kapsomero, kapsomeri pa se sami sestavijo, da tvorijo kapsido.
Kaj so Protomerji?
Protomeri so strukturne enote oligomernih proteinov. Protomer vsebuje vsaj dve različni polipeptidni verigi. Pogosteje vsebujejo več polipeptidov. V virusnih kapsidah se protomeri sami sestavijo in tvorijo kapsomere, ki so morfološke enote kapsid. Protomerji se povezujejo med seboj preko specifičnih vezi in se sami sestavljajo.
Slika 01: Protomerji
V virusu tobačnega mozaika se protomeri združijo in tvorijo dvoslojni disk, ki ovije genom RNA. Tako ti protomeri virusa tobačnega mozaika končno tvorijo dolgo, togo votlo cev, ki mu daje vijačen videz. Pri ikozaedrski simetriji se protomeri združijo v enote petih ali šestih kapsomer in se nato zgostijo v 20 ploskev enakostraničnega trikotnika in 20 vrhov.
Kaj so kapsomeri?
Kapsomeri so strukturne beljakovinske podenote virusne kapside. So tudi morfološke podenote virusov. Strukturno je kapsida skupek kapsomer. Vsaka kapsomera ima več protomerov, ki se med seboj sestavijo sami. Poleg tega so kapsomeri v kapsidi drugače razporejeni, da zagotovijo obliko virusne kapside. V zvezi s tem so spiralne, ikozaedrične in kompleksne tri vrste razporeditev kapsomer v virusih. Vendar pa je razporeditev kapsomer značilna za določen virus. Kapsomeri se povezujejo med seboj prek interkapsomernih tripleksov, sestavljenih iz dveh kopij enega proteina in ene kopije drugega.
Slika 02: Kapsomeri
Poleg tega ima vsak virus končno število kapsomer. Virus hepatitisa B ima ikozaedrično kapsido, ki vsebuje 180 kapsomer. Rekombinantni adenovirus ima kapsido, ki vsebuje 252 kapsomer. Herpesvirusi imajo v svojih kapsidah 162 kapsomer. Poleg tega ima enterovirus v svoji kapsidi 60 kapsomerov. Podobno imajo različni virusi različno število kapsomer v svoji beljakovinski ovojnici.
Kapsomeri opravljajo več funkcij v virusih. Kapsomeri ščitijo virusni genom pred fizikalnimi, kemičnimi in encimskimi poškodbami. Poleg tega so kapsomeri pomembni pri uvajanju virusnega genoma v gostitelja, tako da se zlahka adsorbirajo na površino celice gostitelja.
Kakšne so podobnosti med protomeri in kapsomeri?
- Protomeri in kapsomeri so proteinske strukture.
- Protomeri so podenote kapsomer, medtem ko so kapsomeri podenote virusne kapside.
- Tako protomeri kot kapsomeri se lahko sestavijo sami.
Kakšna je razlika med protomeri in kapsomeri?
Protomeri so strukturne enote, ki tvorijo oligomerne proteine, medtem ko so kapsomeri morfološke enote virusnih kapsid. Torej, to je ključna razlika med protomeri in kapsomeri. Poleg tega se protomeri združujejo v kapsomere, medtem ko se kapsomeri združujejo v kapsido.
Spodnja infografika povzema razlike med protomeri in kapsomeri.
Povzetek – Protomerji proti kapsomeram
Protomeri so podenote kapsomer, medtem ko so kapsomeri proteinske podenote virusne kapside. Tako je kapsomera agregacija protomerov, medtem ko je kapsida agregacija kapsomerov. Razporeditev protomerov ali razporeditev kapsomer daje obliko ali simetrijo določenemu virusu. Glede na razporeditev kapsomer sta spiralna in ikozaedrična oblika ali simetrija, ki ju opazimo pri virusih. Torej, to povzema razliko med protomeri in kapsomeri.
