Ključna razlika med NAAT in PCR je, da je NAAT metoda, ki pomnoži genetski material na več načinov, vključno z verižno reakcijo s polimerazo, premikom verige ali pomnoževanjem s transkripcijo, medtem ko je PCR metoda, ki pomnoži genetski material samo z termično kroženje.
Patogene v glavnem identificiramo s pomnožitvijo njihovega genetskega materiala. Večina tehnik na tem področju se osredotoča na odkrivanje genetskega materiala patogena z ojačanjem specifičnih zaporedij v realnem času. Zato so rezultati v diagnostičnem kontekstu izdelani zelo hitro. NAAT, PCR, biosenzor in LCR je več tehnik, ki se uporabljajo v laboratorijih za pomnoževanje genetskega materiala patogena.
Kaj je NAAT?
Test pomnoževanja nukleinske kisline (NAAT) je metoda v molekularni biologiji, ki pomnoži genetski material z uporabo več načinov, kot je verižna reakcija s polimerazo, pomnoževanje s premestitvijo verige ali pomnoževanje s transkripcijo. Pomnoževanje genskega materiala je mogoče izvesti tudi s tehnikami, kot sta verižna reakcija ligacije in reakcija razvejane DNA (kvantipleks b DNA) v postopku NAAT. NAAT uporablja specifičnost združevanja baz Watson-Crick. V postopku NAAT se enoverižna sonda ali molekula primerja hibridizira s ciljno molekulo DNA ali RNA. Zato je zasnova sondnega pramena zelo pomembna za izboljšanje občutljivosti in specifičnosti zaznavanja. Nato naslednji korak NAAT pomnoži genetski material tako, da naredi veliko kopij za odkrivanje.
Slika 01: NAAT
NAAT se trenutno uporablja za odkrivanje več patogenov, kot so Neisseria gonorrhea, Chlamydia trachomatis, Mycobacterium tuberculosis in SARS-COV2. Poleg tega je test NAAT razvit za skrajšanje obdobja okna. Obdobje okna je časovno obdobje med tem, ko je bil pacient okužen, in ko so testi protiteles pokazali, da so pozitivni. Poleg tega je presejalno metodo NAAT prvič odobrila leta 1999 FDA. NAAT ima veliko prednosti, vključno z zaznavanjem nizkih ravni DNA ali RNA, visoko občutljivostjo in visoko specifičnostjo.
Kaj je PCR?
PCR je metoda v molekularni biologiji, ki pomnoži genetski material samo s termičnim kroženjem. PCR pomeni verižna reakcija s polimerazo. Je test za odkrivanje genetskega materiala iz določenega organizma, kot so bakterije, glive in virusi. Pri diagnozi bolezni PCR zazna prisotnost patogena, če ima oseba v času testa patogen. Pri diagnosticiranju bolezni ima protokol PCR več korakov, vključno z zbiranjem vzorcev, ekstrakcijo DNK, PCR in sekvenciranjem. Pri testiranju patogenov se z zbranim vzorcem pridobi genetski material (DNK ali RNK). Postopek PCR zahteva posebne kemikalije, primerje in encime za proizvodnjo milijonov kopij genetskega materiala v stroju PCR, imenovanem termični cikler. Ko je pomnožen iz produkta PCR, je patogen mogoče odkriti. Znanstveniki uporabljajo posebno programsko opremo za interpretacijo rezultatov.
Slika 02: PCR
Poleg tega se v raziskavi trenutno uporabljajo različne vrste PCR. Med njimi je več RT-PCR, Multiplex PCR, RAPD in Nested PCR. PCR je uporaben predvsem pri odkrivanju faringitisa (Streptococcl pharyngitis), atipične pljučnice (Chlymydia pneumoniae), ošpic (Morbillivirus), hepatitisa (HBV) in ulcerativne urogenitalne okužbe (Haemophilus ducreyi).
Kakšne so podobnosti med NAAT in PCR?
- NAAT in PCR sta dve pomembni molekularni biološki metodi, ki se uporabljata za pomnoževanje genskega materiala.
- Nukleinske kisline (DNA ali RNA) se pomnožijo z obema tehnikama.
- So hitre in hitre tehnike.
- Obe tehniki se trenutno uporabljata za diagnozo bolezni.
- Dragi so od običajnih metod.
Kakšna je razlika med NAAT in PCR?
NAAT je metoda v molekularni biologiji, ki pomnoži genetski material z uporabo več metod, medtem ko je PCR metoda v molekularni biologiji, ki pomnoži genetski material samo s termičnim kroženjem. NAAT uporablja različne tehnike pomnoževanja genskega materiala, kot so verižna reakcija s polimerazo, pomnoževanje s premikom verige, pomnoževanje s transkripcijo, verižna reakcija z ligacijo in reakcija razvejane DNA (kvantipleks b DNA). Po drugi strani PCR uporablja različne tehnike pomnoževanja genskega materiala, kot je RT-PCR. Multipleksni PCR, RAPD, ugnezdeni PCR. To je torej ključna razlika med NAAT in PCR.
Spodnja infografika prikazuje razlike med NAAT in PCR v obliki tabele za vzporedno primerjavo.
Povzetek – NAAT proti PCR
V laboratorijih se uporabljajo različna molekularna biološka orodja za pomnoževanje genskih materialov. NAAT, PCR, biosenzor in LCR je več takih tehnik. NAAT je molekularna biološka tehnika, ki pomnoži genetski material na več načinov, kot je verižna reakcija s polimerazo, premik verige ali pomnoževanje, posredovano s transkripcijo. PCR je metoda v molekularni biologiji, ki pomnoži genetski material z uporabo termičnega kroženja. To je torej ključna razlika med NAAT in PCR.
