Ključna razlika med testom LAMP in PCR je, da se LAMP izvaja pri konstantni temperaturi (60-650C) za proizvodnjo kopij DNK s pomnoževanjem, medtem ko se PCR izvaja z nizom temperaturnih sprememb za izdelavo kopij DNK s pomnoževanjem.
LAMP in PCR sta tehniki pomnoževanja in vitro, ki se uporabljata za proizvodnjo na tisoče kopij DNK. Količina DNK, proizvedene v LAMP, je veliko višja od količine, proizvedene v tehnikah PCR, kot je RT-PCR. LAMP je novejša tehnika v primerjavi s tehniko PCR. Vendar je tehnično preprosta in jo lahko usposobljeni znanstvenik izvede v laboratorijskih pogojih. Zaradi tega je potencialno uporabna tehnika za odkrivanje COVID-19. Vendar je RT-PCR trenutni standardni test za COVID-19. Čeprav so te tehnike dobro znane raziskovalcem in zdravnikom z ozadjem pomnoževanja DNK, so lahko širši skupnosti še vedno relativno neznane.
Kaj je LAMP Test?
Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) za teste COVID-19 se začne z zbiranjem vzorcev iz nosu ali grla z uporabo brisa. Vzorce je mogoče zbrati tudi z drugimi metodami, kot je sluz iz močnega kašlja. Tako kot tehnika PCR, kot je RT-PCR, se virusna RNA v vzorcu najprej pretvori v DNA, kar omogoča njeno kopiranje. Reakcija LAMP se izvaja pri konstantni temperaturi (60-650C).
Pomnoževanje virusne DNK, ki vključuje tehnologijo LAMP in reagente, je mogoče zaznati, ko je reakcijska mešanica motna zaradi proizvodnje "magnezijevega pirofosfata". Ta oblačnost omogoča znanstvenikom in klinikom enostavno diagnozo COVID-19. Natančnost rezultatov testa je mogoče izboljšati z uporabo posebnih fluorescentnih barvil ali barvil, ki spreminjajo barvo v reakcijski mešanici. Ta barvila medsebojno delujejo z virusno DNK in lahko izmerimo intenzivnost svetlobe ali barvne spremembe, da dobimo približno število molekul virusne RNK, ki je bilo na začetku v vzorcu.
Kaj je test PCR?
PCR je zelo pogosta znanstvena tehnika, ki se že 20-30 let pogosto uporablja v raziskavah in medicini za odkrivanje DNK. PCR testi se uporabljajo neposredno za odkrivanje antigena z odkrivanjem virusne RNA. Na splošno je virusna RNA prisotna v telesu, preden se odkrijejo protitelesa ali se pojavijo simptomi bolezni. Zato lahko s testom PCR zgodaj ugotovimo, ali ima nekdo virus ali ne. Trenutno je PCR standardni test za odkrivanje COVID-19. Obstajajo različne vrste tehnik PCR, kot so PCR v realnem času, ugnezdeni PCR, multipleks PCR, PCR z vročim zagonom in PCR na dolge razdalje itd. PCR uporablja niz temperaturnih sprememb za izdelavo kopij DNK s pomnoževanjem.
RT-PCR je posebna različica tehnike PCR. Uporablja se, ko se odkrije RNA. Zdaj se uporablja za testiranje na COVID-19. RT-PCR je dokaj občutljiva in zanesljiva tehnika. Pri RT-PCR se po odvzemu vzorca uporabijo kemikalije za odstranitev nezaželenih beljakovin, maščob in drugih molekul, pri čemer ostane RNA. Encimi testnega kompleta najprej pretvorijo RNK v DNK, ki nato pomnoži virusno DNK, da odkrije virus. Fluorescentna barvila se običajno uporabljajo za vezavo na pomnoženo DNA in proizvajajo svetlobo. Naprava to lahko prebere in ustvari rezultat testa.
Kakšne so podobnosti med testom LAMP in PCR?
- So tehnike ojačanja.
- Oba proizvajata kopirano DNK.
- So zelo občutljive in zanesljive tehnike kot imunske tehnike, kot je odkrivanje protiteles.
- Oba se uporabljata za testiranje na COVID-19.
Kakšna je razlika med testom LAMP in PCR?
Ključna razlika med testoma LAMP in PCR je v tem, da pri LAMP pomnoževanje dosežemo s konstantno temperaturo (60-650C), medtem ko pri PCR ciklično potrebne temperature. Trenutno je na voljo več vrst tehnik LAMP. Toda najpomembnejši za odkrivanje COVID-19 sta izotermalna tehnika z zanko povratne transkripcije (RT-LAMP) in pomnoževanje s transkriptom (TMA). Poleg tega so v klinični praksi trenutno na voljo tudi različne vrste tehnik PCR za diagnozo bolezni, kot so PCR v realnem času, RT-PCR, ugnezdeni PCR, multipleks PCR, PCR z vročim zagonom, PCR z dolgim dosegom itd.
Spodnja infografika navaja razlike med testom LAMP in PCR v obliki tabele.
Povzetek – test LAMP proti PCR
Izotermično pomnoževanje, posredovano z zanko, je podoben postopek kot testi PCR, kot je RT-PCR, vendar proizvede več kopij virusne DNK pri konstantni temperaturi. Test verižne reakcije s polimerazo je trenutno najpogostejša in standardna oblika testiranja na svetu za diagnosticiranje bolezni, kot je na primer diagnoza COVID-19. Velja za dokaj zanesljivo. PCR uporablja niz temperaturnih sprememb za izdelavo kopij DNK s pomnoževanjem. To torej povzema razliko med testom LAMP in PCR.
