DNA polimeraza proti RNA polimerazi
To sta dva različna encima, odgovorna za različne funkcije, ki potekajo na celični ravni. Ti encimi uravnavajo predvsem tvorbo verig DNA in RNA. Ta članek namerava razpravljati o glavnih razlikah teh izjemno pomembnih encimov za številne procese ohranjanja življenja.
DNK polimeraza
Encim DNA polimeraza začne delovati med replikacijo DNA, v koraku razporejanja ustreznih nukleotidov za tvorbo vodikovih vezi med ustreznimi dušikovimi bazami obstoječe in nove verige DNA. Ta encim postane funkcionalen, potem ko strukturo dvojne vijačnice DNA razstavi ali odvije encim eksonukleaza, imenovan DNA helikaza. Polimerizacija deoksiribonukleotidov se vedno začne na 3' koncu verige DNA. Obstaja veliko vrst DNA polimeraz in vsaka vrsta je sestavljena iz proteina, kar pomeni, da vsebuje zaporedje baz, edinstveno za določen encim. V verigah polimeraze človeške DNA je približno 900–1000 aminokislin. Običajno je med procesom replikacije DNA polimeraza sposobna kopirati zaporedje dušikovih baz, tako da lahko proizvede več enakih verig iz enega encima. Variacije tega encima pri različnih vrstah niso zelo izrazite, saj so katalitične podenote encimske strukture pri mnogih vrstah skoraj enake. Vendar pa je bilo na podlagi teh majhnih sprememb identificiranih sedem družin DNA polimeraz, imenovanih A, B, C, D, X, Y in RT. Vse te vrste imajo skupaj 15 različnih encimov med evkarionti in 5 med prokarionti.
RNA polimeraza
RNA polimeraza je glavni encim, ki katalizira proizvodnjo verig RNA. Predloge zaporedij dušikovih baz DNK običajno temeljijo na proizvodnji RNK in ta encim ima številne funkcije. Prvič, določen del verige DNK (običajno gen) se odvije s pretrganjem vodikovih vezi med ustreznimi bazami nasprotnih verig s polimerazo RNK. Po tem poteka kopiranje baznega zaporedja z zamenjavo uracila za timin od 3' konca do 5' konca verige DNA. Začetna točka polimerizacije RNA verige DNA se imenuje promotor, medtem ko je končni konec znan kot terminator. Ker ta encim tvori verigo z uporabo ribonukleotidov, se za sklicevanje uporablja izraz RNA polimeraza. RNA polimeraza lahko proizvede vrsto produktov, vključno s sporočilno RNA, ribosomsko RNA, prenosno RNA, mikro RNA in ribozimsko ali katalitično RNA. Ker je RNA polimeraza sposobna odviti verigo DNA, ne potrebuje drugega encima za razstavljanje strukture dvojne vijačnice. V bakterijah je RNA polimeraza več vrst, ki jih označujemo kot α2, β, β’ in ω. Te bakterijske RNA polimeraze se med seboj strukturno in funkcionalno nekoliko razlikujejo. Obstajajo transkripcijski kofaktorji, ki so vezani na RNA polimerazo na različnih mestih, da izboljšajo delovanje, zlasti pri nekaterih bakterijah, kot je E. coli.
Kakšna je razlika med DNA polimerazo in RNA polimerazo?
• DNK polimeraza tvori verigo DNK iz deoksiribonukleotidov, medtem ko RNK polimeraza tvori verige RNK iz ribonukleotin.
• RNA polimeraza lahko opravlja veliko več funkcij v primerjavi s tem, kar bi lahko opravljala DNA polimeraza.
• RNA polimeraza tvori različne produkte, ne pa tudi DNA polimeraza.
• DNA polimeraza začne delovati od 3' konca verige DNA, medtem ko lahko RNA polimeraza začne delovati kjer koli v verigi DNK od 3' konca do 5' konca.
