Ključna razlika med dATP in ddATP je, da dATP ne prekine sinteze DNK, medtem ko ddATP lahko prekine sintezo DNK. To je zato, ker ima ddATP atom H, vezan na položaj 3' pentoznega sladkorja, medtem ko ima dATP skupino OH, vezano na položaj 3'.
dNTP so gradniki DNK. Obstajajo štiri vrste dNTP glede na purinske ali pirimidinske baze - dATP je ena izmed njih. Dušikova baza dATP je adenozin. ddNTP so nukleotidi, ki se uporabljajo pri Sangerjevem sekvenciranju. Obstajajo štiri vrste ddNTP. ddATP je ddNTPs.
Kaj je dATP?
Deoksiadenozin trifosfat je nukleotid, ki je gradnik DNK. Encim DNA polimeraza uporablja dATP kot substrat za sintezo DNA. dATP ima tri komponente: molekulo sladkorja deoksiriboze, adenozin in tri fosfatne skupine. Zato je purin nukleozid trifosfat. Kemijska formula dATP je C10H16N5O12 P3, in njegova molekulska masa je 491.182.
Slika 01: dATP
dATP se razlikuje od ATP (adenozin trifosfata) glede na sestavine sladkorja. ATP vsebuje sladkor ribozo. bazni pari dATP z uracilnim nukleotidom med transkripcijo. Poleg tega, da sodeluje pri sintezi DNK, lahko dATP deluje kot molekula za prenos energije, ki ohranja tudi sposobnost preživetja celic. Visoka raven dATP v telesu je toksična, saj lahko deluje kot nekonkurenčni zaviralec za encim ribonukleotid reduktazo. Lahko povzroči oslabljeno delovanje imunskega sistema.
Kaj je ddATP?
Dideoksiadenozin trifoafat ali ddATP je ena od štirih vrst nukleotidov, ki se uporabljajo v Sangerjevi metodi zaporedja. Strukturno ima ddATP tudi tri komponente, podobne dATP. So adeninska baza, sladkor deoksiriboza in trije fosfati.
Slika 02: ddATP
Za razliko od dATP, ddATP nima OH skupine na položaju 3' pentoznega sladkorja, da bi lahko tvoril fosfodiestrsko vez s sosednjim nukleotidom in nadaljeval podaljševanje verige. Ima atom H na položaju 3'. Torej, ko je ddATP vključen, se sinteza DNK konča. To je osnovno načelo Sangerjevega zaporedja. Zato ddATP deluje kot zaviralec podaljšanja verige pri Sangerjevem sekvenciranju. Pri Sangerjevem sekvenciranju se uporabljajo štiri epruvete in v eno epruveto se doda ddATP.
Kakšne so podobnosti med dATP in ddATP?
- dATP in ddATP sta nukleotida.
- Oba sta sestavljena iz adenina, deoksiriboze in treh fosfatov.
- So organske spojine.
- Tako dATP kot ddATP sta dodana v epruvete pri Sangerjevem sekvenciranju.
Kakšna je razlika med dATP in ddATP?
dATP ima OH skupino na 3' položaju pentoznega sladkorja, medtem ko ddATP nima OH skupine na 3' položaju pentoznega sladkorja. Poleg tega je dATP monomer, ki se uporablja pri sintezi DNA, medtem ko se ddATP uporablja za prekinitev podaljšanja verige med Sangerjevim sekvenciranjem. Torej, to je ključna razlika med dATP in ddATP. Poleg tega lahko dATP tvori fosfodiesterske vezi, medtem ko ddATP ne more tvoriti fosfodiestrskih vezi.
Spodnja infografika prikazuje več razlik med dATP in ddATP v obliki tabele za vzporedno primerjavo.
Povzetek – dATP proti ddATP
Na kratko, dATP je predhodnik sinteze DNK, medtem ko je ddATP nukleotid, ki se uporablja za prekinitev sinteze DNK pri Sangerjevem sekvenciranju. Poleg tega ima dATP skupino OH na položaju 3' pentoznega sladkorja in omogoča tvorbo fosfodiesterske vezi z naslednjim nukleotidom. Medtem ddATP nima skupine OH na položaju 3'; zato ne more tvoriti fosfodiesterske vezi z naslednjim nukleotidom. Posledično se zaporedje DNK preneha raztezati. To torej povzema razliko med dATP in ddATP.
