Ključna razlika med promotorjem aktivatorja in represorjem je njuna funkcija. Aktivator olajša regulacijo procesa transkripcije z vezavo na ojačevalce, medtem ko je promotor mesto, na katerem se veže RNA polimeraza in pride do iniciacije transkripcije, represor pa zmanjša transkripcijo z vezavo na dušilce zvoka.
Transkripcija je proces sintetiziranja komplementarne mRNA z uporabo predloge DNK. Proces poteka pri evkariontih v jedru, pri prokariontih pa v citoplazmi. Transkripcija ima tri glavne stopnje: iniciacijo, elongacijo in terminacijo. Aktivatorji in represorji uravnavajo začetek transkripcije, promotorji pa so pomembni pri vezavi RNA polimeraze. RNA polimeraza je glavni encim, ki posreduje pri transkripciji.
Kaj je aktivator?
Aktivator je transkripcijski faktor, ki se veže na ojačevalne regije za uravnavanje transkripcije. Ko je enkrat vezan, povzroči spremembo orientacije vzorčne verige, kar aktivira ali poveča transkripcijo. Poleg tega bo spodbujal vezavo RNA polimeraze na promotorsko mesto za začetek transkripcije.
Slika 01: Aktivator
Aktivatorji so pogosto beljakovinske molekule. Spodbujajo anabolično pot izražanja genov. Funkcija aktivatorja je pretežno opažena pri evkariontski regulaciji transkripcije.
Kaj je promotor?
Promotorska regija gena je regija, kjer poteka vezava RNA polimeraze na začetku transkripcije. Promotorske regije pri prokariontih in evkariontih se razlikujejo. Aktivacija promotorja je pomemben korak pri nadzoru in aktivaciji transkripcije. Prokariontske promotorske regije so prisotne v regijah -35 in -10 navzgor od mesta začetka transkripcije. Regija promotorja -10 se imenuje tudi polje TATA ali polje pribnow. Sigma faktor bakterijske RNA polimeraze prepozna promotor in se veže v zaprt promotorski kompleks. Sledi odvijanje dvojnih niti, kar ima za posledico odprt promotorski kompleks. Končno zapusti sigma faktor polimeraze RNA, ki začne transkripcijo.
Slika 02: Promotor
Pri evkariontih poteka aktivacija promotorja preko več faktorjev iniciacije transkripcije. V evkariontih obstajata dve glavni vrsti promotorjev. So promotorji brez TATA in promotorji TATA.
Kaj je represor?
Represor je transkripcijski faktor, ki uravnava proces prepisovanja z vezavo na dušilne regije. To prepreči vezavo RNA polimeraze na promotor. To je ključna enota celičnega mehanizma za zaustavitev prepisovanja. Tukaj se represor veže na območje dušilca zvoka in blokira proces prepisovanja tako, da zmanjša hitrost in popolnoma ustavi proces.
Slika 03: Represor
Transkripcijski represorji se odzivajo na zunanje dražljaje. To tudi preprečuje vezavo aktivatorskih promotorjev na promotorske regije. Korepresorji so podkategorija represorjev in zavirajo začetek transkripcije z rekrutiranjem histonske deacetilaze. Histon deacetilaza poveča pozitivni naboj na histonskem proteinu. To okrepi interakcijo med DNK in histoni ter zmanjša dostopnost DNK za prepisovanje.
Kakšne so podobnosti med promotorjem aktivatorja in represorjem?
- Aktivatorji, promotorji in represorji so vključeni v proces transkripcije.
- Njihova glavna vloga je med začetkom transkripcije.
- Poleg tega delujejo kot regulacijski faktorji transkripcije.
- Vsi olajšajo natančno vezavo RNA polimeraze.
Kakšna je razlika med promotorjem aktivatorja in represorjem?
Activator olajša uravnavanje procesa prepisovanja z vezavo na ojačevalce. Medtem se RNA polimeraza med začetkom transkripcije veže na promotorsko regijo. Medtem ko represor zmanjša proces transkripcije z vezavo na dušilce zvoka. To je torej ključna razlika med promotorjem aktivatorja in represorjem. Poleg tega so aktivatorji in represorji pogosto proteini, ki uravnavajo transkripcijo, medtem ko je promotor element DNK, ki je prisoten v zgornjih območjih gena. Poleg tega tako aktivatorji kot promotorji pospešijo proces prepisovanja, medtem ko represorji zavirajo proces prepisovanja.
Spodnja infografika prikazuje razlike med promotorjem aktivatorja in represorjem v obliki tabele za vzporedno primerjavo.
Povzetek – Aktivator vs. Promotor vs. Represor
Aktivator, promotor in represor so transkripcijski dejavniki, ki vplivajo na hitrost transkripcije. Ključna razlika med aktivatorskim promotorjem in represorjem je v tem, da aktivator olajša regulacijo procesa transkripcije z vezavo na ojačevalce, medtem ko promotor olajša vezavo RNA polimeraze med začetkom transkripcije, represorji pa zmanjšajo transkripcijo z vezavo na dušilce zvoka. Aktivatorji in represorji so pogosto proteinske molekule, ki se vežejo na regulatorne regije v genu in povzročijo orientacijske spremembe v DNA. Promotorji so mesta navzgor. Vezava RNA polimeraze poteka na promotorskih mestih. Torej, to je razlika med promotorjem aktivatorja in represorjem.
