Ključna razlika med feredoksinom in rubredoksinom je v tem, da ima feredoksin bistveno nižji redoks potencial v primerjavi z rubredoksinom.
Tako feredoksin kot rubredoksin sta beljakovini, ki vsebujeta železo. Vendar pa lahko najdemo feredoksin v bakterijskih oblikah in v rastlinah, ker je kloroplast-protein. Vendar pa je rubredoksin beljakovina, ki se pojavlja le v bakterijah in arhejah. Ti dve spojini imata zelo podobno strukturo.
Kaj je Ferredoxin?
Ferredoxin je beljakovina, ki vsebuje železo in žveplo. Sodeluje pri posredovanju prenosa elektronov v različnih presnovnih reakcijah. To so majhne beljakovine, ki so topne v vodi in obstajajo v kloroplastih. Atomi železa in žvepla v tem proteinu so razporejeni v grozde železo-žveplo. Lahko delujejo kot biološki kondenzatorji s sprejemanjem in odvajanjem elektronov. Tu se oksidacijsko stanje atomov železa spremeni od +2 do +3. Zato delujejo kot sredstva za prenos elektronov v redoks reakcijah, ki potekajo v biološkem okolju. Primerjalno je redoks potencial tega proteina nizek. Molekula proteina feredoksina lahko vsebuje dva, tri ali štiri atome železa na molekulo proteina. Obstajajo tri običajne vrste feredoksinov: Fe2S2 feredoksini, Fe4S 4 feredoksini in Fe3S4 feredoksini.
Glavna vloga feredoksina je dodeljevanje visokoenergijskih elektronov v kloroplastu in ti proteini sodelujejo pri distribuciji elektronov, ki so potrebni za fiksacijo ogljikovega dioksida, redukcijo nitrila, redukcijo sulfita, sintezo glutamata, ciklični tok elektronov itd.
Kaj je rubredoksin?
Rubredoksin je beljakovina, ki vsebuje železo in jo lahko najdemo v bakterijah in arhejah. Je vrsta beljakovin z nizko molekulsko maso (običajno so beljakovine spojine z visoko molekulsko maso). Vendar za razliko od feredoksina protein Rubredoksin ne vsebuje anorganskih sulfidov. Glavna vloga rubredoksina je, da sodeluje pri mehanizmih prenosa elektronov v redoks reakcijah, ki se pojavljajo v bioloških sistemih.
Če upoštevamo strukturo rubredoksina, vsebuje osrednji atom železa, ki ima skoraj tetraedrično geometrijo. Štiri skupine, ki so vezane na ta atom železa, so cisteinski ostanki. Večina proteinov rubredoksina je vodotopnih kemičnih vrst. Vendar pa obstajajo nekatere netopne vrste, ki obstajajo kot membransko vezane beljakovine. Npr. Rubredoksin-A.
Med mehanizmom prenosa elektronov se oksidacijsko stanje osrednjega atoma železa spremeni od +2 do +3. To spremembo oksidacijskega stanja zlahka prepoznamo, ker se barva spremeni iz rdeče v brezbarvno. Med tem spreminjanjem kovinski ion ostane v stanju z visokim vrtenjem, ker je koristno zmanjšati strukturne spremembe proteina. Običajno je redukcijski potencial rubredoksina višji kot feredoksina; je v območju od +50 mV do -50 mV.
Kakšna je razlika med feredoksinom in rubredoksinom?
Ferredoxin in Rubredoxin sta beljakovinski spojini, ki kot komponenti vsebujeta železo in žveplo. Ključna razlika med feredoksinom in rubredoksinom je v tem, da ima feredoksin bistveno nižji redoks potencial v primerjavi z rubredoksinom. Redoks potencial feredoksina je približno -420 mV, redoks potencial rubredoksina pa se giblje od -50 do +50 mV. Poleg tega lahko feredoksin vsebuje dva, tri ali štiri atome železa na molekulo beljakovine, vendar je v rubredoksinu en centralni atom železa. Vendar imata obe molekuli zelo podobno tetraedrsko geometrijo okoli atomov železa.
Poleg tega feredoksin vsebuje anorgansko žveplo kot komponento v proteinski molekuli, vendar v rubredoksinu ni anorganskega žvepla. Če upoštevamo pojavnost, se lahko feredoksin pojavlja tako v bakterijskih oblikah kot v rastlinah, vendar se rubredoksin pojavlja v bakterijah in arhejah.
Spodnja tabela povzema razlike med feredoksinom in rubredoksinom.
Povzetek – Ferredoxin proti Rubredoxin
Ferredoxin in Rubredoxin sta beljakovinski spojini, ki kot komponenti vsebujeta železo in žveplo. Ključna razlika med feredoksinom in rubredoksinom je v tem, da ima feredoksin precej nižji redoks potencial v primerjavi z rubredoksinom.
