Ključna razlika med CDS in cDNA je, da je CDS ali kodirno zaporedje del zapisa, ki se dejansko prevede v beljakovino, medtem ko je zaporedje cDNA zaporedje DNA, pridobljeno iz mRNA z reverzno transkripcijo.
Gen je nukleotidno zaporedje, ki kodira protein. Sestavljen je iz različnih regij, kot so promocijska regija, mesto iniciacije transkripcije, eksoni, začetni kodon, introni in stop kodon. Zato ima gen tako kodirajoča kot nekodirajoča zaporedja. Kodirne sekvence ali CDS se nanašajo na eksone in dva kodona, ki sta začetni kodon in stop kodon. To je zaporedje, ki se dejansko prevede v protein. Nasprotno pa je cDNA zaporedje DNA, pridobljeno iz mRNA z reverzno transkripcijo.
Kaj je CDS?
CDS ali kodirno zaporedje je del gena, ki se dejansko prevede v beljakovino. Sestavljen je iz eksonov in dveh kodonov kot kodona AUG in stop kodona. Za razliko od cDNA CDS ne vsebuje dveh neprevedenih regij: 5' UTR in 3' UTR. Poleg tega introni niso vključeni v CDS.
Slika 01: Zaporedje kodiranja
V primerjavi s celotnim genomom in posameznikom so kodirna zaporedja le majhen delež. Kodirno zaporedje je sestavljeno iz potrebnega nukleotidnega zaporedja za izdelavo aminokislinskega zaporedja proteina.
Kaj je cDNA?
cDNA ali komplementarna DNA je zaporedje DNA, ustvarjeno iz zaporedja mRNA. Sintetizira se s postopkom, imenovanim reverzna transkripcija. Encim reverzna transkriptaza katalizira sintezo cDNA, zaporedje mRNA pa deluje kot matrica za sintezo cDNA. V bistvu se lahko mRNA evkariontskih celic ekstrahira in očisti, da se naredi cDNA. Po konstruiranju cDNA iz mRNA jih je mogoče klonirati v bakterijsko celico, da bi naredili knjižnice cDNA. Knjižnice cDNA so pomembne za analizo kodirnih regij, genskih funkcij in izražanja genov itd.
Slika 02: cDNA
Za razliko od kodirnega zaporedja, cDNA vsebuje dva UTR, ki sta 3' UTR in 5' UTR. Podobno kot kodirno zaporedje cDNA ne vsebuje intronov.
Kakšne so podobnosti med CDS in cDNA?
- CDS in cDNA sta nukleinski kislini.
- Izdelani so iz deoksiribonukleotidov.
- Tako CDS kot CDNA ne vsebujeta intronov, ki so nekodirajoče regije.
- Obe vsebujeta genetsko kodo ali informacije za proizvodnjo beljakovine.
Kakšna je razlika med CDS in cDNA?
CDS ali kodirno zaporedje je del gena, ki se dejansko prevede v beljakovino. Po drugi strani pa je zaporedje cDNA zaporedje DNA, pridobljeno iz mRNA z reverzno transkripcijo. Torej, to je ključna razlika med CDS in cDNA. Poleg tega je CDS sestavljen iz eksonov in dveh kodonov, ki sta začetni kodon in stop kodon. V nasprotju s tem je cDNA sestavljena iz celotnega zaporedja mRNA in dveh UTR.
Poleg tega se sinteza cDNA izvede umetno iz mRNA z reverzno transkripcijo, medtem ko se CDS nahajajo v genomski DNA.
Spodnja infografika prikazuje več primerjav za razlikovanje med CDS in cDNA.
Povzetek – CDS proti cDNA
Kodirno zaporedje in cDNA sta dve vrsti nukleotidnih zaporedij. Kodirno zaporedje je znotraj gena, medtem ko je cDNA sintetizirana umetno. Kodirno zaporedje ima eksone in dva kodona, medtem ko ima cDNA zaporedje mRNA in dva UTR. Tako CDS kot cDNA imata samo nukleotidna zaporedja, ki se dejansko prevedejo v protein. Ne vsebujejo intronov. Za razliko od CDS, proces sinteze cDNA zahteva encim reverzne transkriptaze. Poleg tega se cDNA lahko pretvori v knjižnice cDNA. To torej povzema razliko med CDS in cDNA.
