Ključna razlika med fikocianinom in alofikocianinom je, da fikocianin absorbira in oddaja pri krajših valovnih dolžinah kot alofikocianin.
Fikobiliproteini so družina vodotopnih proteinov, ki so prisotni v cianobakterijah in nekaterih vrstah alg. Fikocianin in alofikocianin sta dva glavna člana te družine.
Kaj je fikocianin?
Fikocianin je pigmentno-proteinski kompleks iz družine fikobiliproteinov, ki zbirajo svetlobo. Drugi pomembni člani te družine vključujejo alofikocianin in fikoeritrin. Ta pigment je pomožni pigment klorofilu. Na splošno so vsi fikobiliproteini v vodi topni kompleksi, ki ne morejo obstajati znotraj membran, kot karotenoidi. Namesto da bi obstajali v membranah, se ti pigmenti nagibajo k agregaciji in tvorijo grozde, ki se lahko oprimejo membran, znani kot fikobilisomi.
Slika 01: Ekstrahirani fikocianinski pigmenti (iz cianobakterij)
Opazimo lahko, da ima fikocianin značilno svetlo modro barvo, ki lahko absorbira oranžno in rdečo svetlobo (blizu 620 nm) in lahko oddaja fluorescenco (okoli 650 nm). Ta barvni pigment lahko najdemo v cianobakterijah in ime "Phycocyanin" izhaja iz grškega pomena za "Phyco", ki se nanaša na "alge", in pripone "cianin" iz grškega pomena za "Kyanos", ki se nanaša na "temno modro".
Običajno imajo molekule fikocianina skupno strukturo z vsemi fikobiproteini. Če upoštevamo strukturo tega pigmenta, se začne s sestavljanjem fikobiliproteinskih monomerov. Ti monomeri so heterodimeri, sestavljeni iz podenot alfa in beta z ustreznimi kromoforji. Kromoforji in podenote so med seboj povezani s tioetersko kemično vezjo.
Podenote strukture fikocianina običajno vsebujejo osem alfa-vijačnic. Monomerne strukture se nagibajo k spontanemu združevanju in tvorijo trimerje v obliki obroča z rotacijsko simetrijo in osrednjim kanalom. Poleg tega se trimeri nagibajo k agregaciji v pare in tvorijo heksamere, ki jim pomagajo dodatni povezovalni proteini. Zato vsaka palica fikobisoma vsebuje dva ali več heksamerov fikocianina.
Kaj je alofikocianin?
Alofikocianin je proteinska molekula, ki prihaja iz družine fikobiliproteinov in je pomožni pigment klorofilu. Drugi člani te družine fikobiliproteinov, ki zbirajo svetlobo, vključujejo fikocianin, fikoeritrin in fikoeritrocianin. Alofikocianinski pigmenti lahko absorbirajo in oddajajo rdečo svetlobo, ta pigment pa zlahka najdemo v cianobakterijah in rdečih algah.
Slika 02: Videz alofikocianina v diagramu
Alofikocianin lahko izoliramo iz različnih vrst rdečih ali modrozelenih alg. Te alge proizvajajo nekoliko drugačne oblike molekule. Na splošno molekula alofikocianina vsebuje dve različni podenoti, imenovani alfa in beta podenota. Vsaka podenota ima en kromofor fikocianobilina.
Obstajajo različne uporabe alofikocianina; veliko instrumentov je bilo razvitih posebej za alofikocianin. Ta komponenta se na primer pogosto uporablja v imunskih testih, vključno s FACS, pretočno citometrijo itd.
Kakšne so podobnosti med fikocianinom in alofikocianinom?
- Fikocianin in alofikocianin sta vodotopni beljakovini
- Oba sta vključena v družino fikobiliproteinov.
Kakšna je razlika med fikocianinom in alofikocianinom?
Fikobiliproteini so družina vodotopnih proteinov, ki so prisotni v cianobakterijah in nekaterih vrstah alg. Fikocianin in alofikocianin sta dva glavna člana te družine. Ključna razlika med fikocianinom in alofikocianinom je v tem, da fikocianin absorbira in oddaja pri krajših valovnih dolžinah kot alofikocianin.
Spodnja infografika navaja več razlik med fikocianinom in alofikocianinom v obliki tabele za vzporedno primerjavo.
Povzetek – Fikocianin proti alofikocianinu
Fikobiliproteini so družina vodotopnih proteinov, ki so prisotni v cianobakterijah in nekaterih vrstah alg. Fikocianin in alofikocianin sta dva glavna člana te družine. Ključna razlika med fikocianinom in alofikocianinom je v tem, da fikocianin absorbira in oddaja pri krajših valovnih dolžinah kot alofikocianin.
