siRNA proti miRNA
RNK so zelo pomembne molekule, ki pomagajo graditi življenje organizmov. Pred kratkim so znanstveniki odkrili majhne RNA, imenovane RNA interferenca ali RNAi, ki delujejo po transkripciji za nadzor izražanja genov. Dve glavni vrsti majhnih RNA sta mikro RNA ali miRNA in majhna moteča RNA ali siRNA. Te molekule v bistvu uravnavajo izražanje genov z zatiranjem ciljnega gena. Tako miRNA kot siRNA imata zelo podobne poti biogeneze, čeprav med njima obstajajo nekatere razlike. Izvor miRNA in siRNA je iz molekul dsRNA. Zrele miRNA so strukturno podobne molekulam siRNA.
miRNA
Mikro RNA ali miRNA so majhne molekule RNA, ki posredujejo pri končni kontroli translacijske regulacije genov. Deregulacija miRNA lahko povzroči razvoj raka in drugih bolezni. Zato je ustrezna regulacija informacij, kodiranih v nekodirajoči regiji miRNA, zelo kritična v številnih temeljnih celičnih procesih.
siRNA
siRNA se imenujejo tudi kratka moteča ali utišajoča RNA in so sestavljene iz dvoverižne RNA z 20 do 25 baznimi pari. Glavna vloga siRNA je motenje izražanja specifičnih genov s komplementarnimi nukleotidnimi sekvencami. siRNA je sestavljena iz kratke dvoverižne RNA s fosforiliranimi 5' konci in hidroksiliranimi 3' konci z dvema previsnima nukleotidoma.
Kakšna je razlika med siRNA in miRNA?
• miRNA, pridobljena iz specifičnih genomskih lokusov, medtem ko siRNA, pridobljena iz mRNA, transpozonov, virusov ali heterokromatske DNA.
• Sinteza miRNA je obdelana iz daljših prekurzorskih lasnih transkriptov (primarna jedrska sekvenca miRNA z endonukleazo RNaze III), medtem ko je sinteza miRNA obdelana iz dolgih bimolekularnih dupleksov RNA.
• Vsaka prekurzorska molekula miRNA lasnice proizvede en dupleks miRNA, medtem ko vsaka prekurzorska molekula siRNA proizvede več dupleksov siRNA.
• zaporedja siRNA so redko ohranjena, medtem ko so zaporedja miRNA dobro ohranjena.
• Vse baze znotraj siRNA prispevajo k njeni ciljni specifičnosti, medtem ko le 5' polovica miRNA prispeva k njeni ciljni specifičnosti.
• miRNA se pogosto veže na 3' neprevedeno regijo ciljnih transkriptov, medtem ko siRNA tvorijo komplementarni dupleks kjerkoli vzdolž ciljne mRNA.
• miRNA določa "hetero- utišanje", medtem ko se siRNA uporablja za "samodejno utišanje".
• miRNA deluje kot signal za preprečevanje prevajanja, medtem ko siRNA fizično preprečuje prevajanje.
