Ključna razlika – splošni proti specifičnim transkripcijskim faktorjem
Polimeraza RNK potrebuje transkripcijske faktorje, da delujejo na vzorčno verigo DNK pri sintezi mRNK. Obstajajo različne vrste transkripcijskih faktorjev. Ti transkripcijski faktorji tvorijo kompleks z verigo DNK. Spremenijo potrditev vzorčne verige ali povečajo afiniteto encima RNA polimeraze do sinteze mRNA v procesu imenovane transkripcije. Obstajata dve glavni vrsti transkripcijskih faktorjev. To so splošni ali bazalni transkripcijski faktorji in specifični transkripcijski faktorji. Splošni transkripcijski faktorji so faktorji, ki se uporabljajo za tvorbo prediniciacijskega kompleksa med procesom transkripcije. Prisotni so v skoraj vseh evkariontih, pri prokariontih pa tvorijo manj zapleten kompleks. Specifični transkripcijski faktorji so bodisi ojačevalci bodisi represorji, ki so specifične sekvence DNA, ki aktivirajo ali zavirajo splošni proces transkripcije. Nekateri specifični transkripcijski faktorji lahko spremenijo samo zaporedje DNA. Ključna razlika med splošnimi transkripcijskimi faktorji in specifičnimi transkripcijskimi faktorji temelji na funkcionalnosti. Splošni transkripcijski faktorji so vključeni v tvorbo prediniciacijskega kompleksa transkripcijskega procesa, medtem ko specifični transkripcijski faktorji sodelujejo pri aktiviranju ali zaviranju transkripcijskega procesa.
Kaj so splošni transkripcijski faktorji?
Splošni ali bazalni transkripcijski faktorji so dejavniki, ki sodelujejo pri tvorbi iniciacijskega kompleksa med transkripcijo. Bistveni so za proces prepisovanja, zato igrajo ključno vlogo pri uspešnem prepisovanju. Obstaja šest ključnih splošnih transkripcijskih faktorjev. So; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIE, TFIIF in TFIIA. Med nastajanjem iniciacijskega kompleksa igrajo različne vloge.
- TFIID – Ta transkripcijski faktor (TF) je vključen v prepoznavanje promotorskega zaporedja (TATA polje).
- TFIIB – TFIIB prepozna kompleks promotor /TFIID. To zagotavlja signal za vezavo glavnega katalizatorskega encima RNA polimeraze.
- TFIIF – Ta transkripcijski faktor je vezan na RNA polimerazo. TFIIF tako sodeluje v procesu tako, da rekrutira RNA polimerazo na pravilno lokacijo.
- TFIIE in TFIIH – Vezava teh transkripcijskih faktorjev označuje konec tvorbe prediniciacijskega. Vezava teh poveča učinkovitost tvorbe prediniciacijskega kompleksa.
- TFIIA spodbuja vezavo TFIID na polje TATA.
Slika 01: Splošni transkripcijski faktorji
Zgoraj omenjeni splošni transkripcijski faktorji so specifični za RNA polimerazo II, ki je vrsta RNA polimeraze, ki podaljša verigo mRNA. Obstajajo splošni transkripcijski faktorji, ki sodelujejo pri RNA polimerazi I in III. Splošni transkripcijski faktorji se lahko razlikujejo tudi glede na vrsto celice, na katero delujejo.
Kaj so posebni transkripcijski faktorji?
Specifični transkripcijski faktorji so regije, ki se nahajajo tudi v zaporedjih DNK. Večinoma so ojačevalci ali zaviralci. Specifični transkripcijski faktorji so specifični cis-delujoči elementi v vzorčni verigi DNK, ki so podvrženi transkripciji. Aktivacija teh specifičnih ojačevalcev in represorjev sodeluje pri povečanju afinitete encima s spreminjanjem orientacije molekule DNA ali z delovanjem kot signalne regije. Posebni transkripcijski faktorji se uporabljajo tudi za induciranje modifikacij verige predloge DNK. Te modifikacije vključujejo predvsem kovalentne modifikacije, kot je metilacija. S tem metilirane regije DNA delujejo kot posebni ojačevalci ali zaviralci procesa prepisovanja.
Slika 02: Specifični transkripcijski faktorji
Posebni transkripcijski faktorji so odvisni od vrste vrste in jih običajno ne najdemo pri vseh evkariontih. Ti transkripcijski faktorji se aktivirajo z različnimi presnovnimi pogoji prek poti prenosa signala. Po aktivaciji uravnavajo izražanje gena na transkripcijski ravni.
Kakšne so podobnosti med splošnimi in posebnimi transkripcijskimi faktorji?
- V procesu transkripcije sta potrebna oba dejavnika.
- Oba dejavnika vplivata na izražanje genov v organizmu.
- Oba dejavnika pomagata uravnavati delovanje RNA polimeraze v procesu prepisovanja.
- Oba dejavnika najdemo predvsem pri evkariontih.
Kakšna je razlika med splošnimi in posebnimi transkripcijskimi faktorji?
Splošno proti posebnemu prepisu |
|
| Splošni transkripcijski faktorji so faktorji, ki se uporabljajo za tvorbo prediniciacijskega kompleksa med procesom transkripcije. | Specifični transkripcijski faktorji so bodisi ojačevalci ali represorji, ki so specifična zaporedja DNK, ki aktivirajo ali zavirajo splošni proces prepisovanja. |
| Vrsta molekule | |
| Splošni transkripcijski faktorji temeljijo na beljakovinah. | Specifični transkripcijski faktorji so nukleotidna zaporedja. |
| Formacija | |
| Splošni transkripcijski faktorji tvorijo prediniciacijski kompleks med začetkom transkripcije. | Določeni transkripcijski faktorji delujejo kot ojačevalci ali zaviralci transkripcije. |
| Vrste | |
| Obstaja šest glavnih tipov; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIF, TFIIE in TFIIA splošnih transkripcijskih faktorjev. | Specifični transkripcijski faktorji so večinoma kategorizirani kot ojačevalci in zaviralci. |
Povzetek – Splošni proti specifičnim transkripcijskim faktorjem
Transkripcijski faktorji so bistveni za regulacijo transkripcije in potrebni za večjo učinkovitost in natančnost procesa. Transkripcijski faktorji so dve glavni vrsti; Splošno/bazalno in specifično. Splošni transkripcijski faktorji so vključeni v tvorbo prediniciacijskega kompleksa med transkripcijo, medtem ko so specifični transkripcijski faktorji regije v sami DNK, ki delujejo kot ojačevalci ali represorji. Splošni transkripcijski faktorji temeljijo na beljakovinah in jih potrebujejo vsi evkarionti. Ni zelo spremenljiv in ostaja kot enotne molekule. Specifični transkripcijski faktor se lahko zelo razlikuje in je odvisen od posameznikove genetske zgradbe. To je razlika med splošnimi in posebnimi transkripcijskimi faktorji.
Prenesite različico PDF Splošni proti specifičnim transkripcijskim faktorjem
Lahko prenesete PDF različico tega članka in jo uporabite za namene brez povezave v skladu z opombo o citiranju. Prenesite PDF različico tukaj. Razlika med splošnimi in posebnimi transkripcijskimi faktorji
