Ključna razlika med insercijskimi in nadomestnimi vektorji je, da ima insercijski vektor zmožnost vstavljanja zmernih dolžin tuje DNK, medtem ko ima nadomestni vektor zmožnost prilagajanja večjih dolžin tuje DNK.
Fažni vektorji so bakteriofagi, ki se uporabljajo za kloniranje. Obstajata dve vrsti vektorjev fagov; sta insercijski vektor in nadomestni vektor. Prav tako so vsi vektorji fagov sestavljeni iz nebistvenih genov. Vendar je treba te gene odstraniti iz fagov, da se omogočijo vstavitve novih tujih DNK.
Kaj je vstavitveni vektor?
Prvič, vstavitveni vektor je najpreprostejša oblika vektorjev za kloniranje lambda. Pravzaprav je to vrsta vektorja faga, ki ima edinstveno restrikcijsko mesto, uvedeno znotraj genoma vektorja na mestu neobvezne DNA. Poleg tega DNK faga ostane brez odstranitve. Ta neodstranitev DNK faga zmanjša velikost vstavkov (tuje DNK), ki jih je treba klonirati znotraj vektorja. Poleg tega so ti vektorji uporabni pri kloniranju in izražanju cDNA. GT10, GT11 in Zap so primeri tega vektorja.
Slika 01: Lambda fag
Insercijski vektor je sestavljen iz enega mesta za prepoznavanje. Primarna funkcija tega vektorja je razviti knjižnice cDNA, pridobljene iz evkariontskih zaporedij mRNA. Poleg tega lahko sprejme le dolžine tuje DNK v razponu med 05-11 kb. Poleg tega ima edinstveno mesto cepitve za vstavljanje tuje DNK.
Kaj so nadomestni vektorji?
Nadomestni vektor ali substitucijski vektor je vrsta vektorja faga, razvitega z odstranitvijo srednjega področja 'fragmenta polnila' fagne DNA. Želeni vložek tuje DNK nadomesti DNK faga.
Slika 02: Nadomestni vektor
Nadomestni vektorji so pomembni pri ustvarjanju genomskih knjižnic, kot sta EMBL4 in Charon40. Ti vektorji lahko sprejmejo večjo dolžino tuje DNK v razponu od 08 do 24 kb. Območje polnila je sestavljeno tudi iz gena, zaradi katerega je vektor faga nesposoben preživeti znotraj bakterijskega gostitelja.
Kakšne so podobnosti med vstavitvenimi in nadomestnimi vektorji?
- Vstavitveni in nadomestni vektorji so fagni vektorji.
- Oba vektorja sprejmeta tuje vstavke DNK.
- Oba sta v pomoč pri ustvarjanju knjižnic DNK.
Kakšna je razlika med vstavitvenimi in nadomestnimi vektorji?
Vstavljanje v primerjavi z nadomestnimi vektorji |
|
| Insercijski vektor je vrsta vektorja faga, ki ima restrikcijsko mesto v genomu faga na mestu izbirne DNK. | Nadomestni vektor je vrsta vektorja faga, razvitega z odstranitvijo srednjega področja 'fragmenta polnila' fagne DNA |
| Velikost vstavljenih fragmentov | |
| 05-11 kb dolžina | 08-24 kb dolžina |
| Fragment polnila | |
| Brez polnilnega fragmenta | Fragment polnila se nadomesti s tujim vstavkom |
| Funkcija | |
| Pomembno za ustvarjanje knjižnic cDNA | Pomembno pri ustvarjanju knjižnic genomov |
| Primeri | |
| GT10, GT11 in Zap so primeri | EMBL4 in Charon40 sta primera |
| Mesto cepitve | |
| Prisotno je edinstveno mesto cepitve | Mesto cepitve vsebuje gene, ki niso bistveni za litični cikel |
Povzetek – Vstavljanje proti zamenjavi vektorjev
Tako vstavitveni kot nadomestni vektorji sta dve vrsti fagnih vektorjev. Oba vektorja imata restrikcijska mesta, ki olajšajo namestitev novih tujih vstavkov DNA. Insercijski vektorji so pomembni pri ustvarjanju knjižnic cDNA, medtem ko so nadomestni vektorji pomembni pri ustvarjanju genomskih knjižnic. Poleg tega se vstavitveni vektorji prilagodijo vstavkom DNA z zmerno dolžino. Toda nadomestni vektorji lahko sprejmejo večje dolžine tujih vstavkov DNK. Na splošno je to ključna razlika med vstavljenimi in nadomestnimi vektorji.
