Ključna razlika med aktivnim in vezavnim mestom je v tem, da aktivno mesto pomaga pri katalizi kemijske reakcije, medtem ko vezavno mesto pomaga pri vezavi liganda na veliko molekulo.
Vezivno mesto je regija na proteinu, DNK ali RNK, na katero se lahko veže ligand. Encimi so beljakovine. Aktivno mesto je območje na encimu, na katerega se substrati lahko vežejo, da se izvede kemična reakcija. Ta posebna regija ima poleg katalitičnega mesta tudi vezavno mesto. Zato vezavna mesta pomagajo le pri vezavi liganda na veliko molekulo, medtem ko aktivna mesta pomagajo tako pri vezavi liganda na veliko molekulo, hkrati pa pustijo, da je podvržen katalizirani kemični reakciji.
Kaj je aktivno spletno mesto?
Aktivno mesto je območje na encimu, na katerega se vežejo substrati kemične reakcije, da pride do katalizirane kemične reakcije. to regijo sestavljata dve podregiji kot vezavno mesto in katalitično mesto. Vezavno mesto vsebuje nekaj ostankov, ki lahko pomagajo pri vezavi substrata (reaktantov) na encim. Katalitično mesto pomaga pri katalizaciji kemične reakcije. Poleg tega je ta regija zelo majhna v primerjavi s celotno prostornino encima; približno 10-20% celotne prostornine encima.
Slika 01: Vezivno mesto in katalitsko mesto aktivnega mesta
Običajno aktivno mesto vsebuje 3-4 aminokisline. preostale aminokisline v encimu, ki sodelujejo pri vzdrževanju terciarne strukture encima. Še pomembneje je, da ima aktivno mesto posebno zasnovo, ki se lahko prilega določenemu substratu. Zato ti encimi reagirajo samo z določenimi substrati. Včasih pa encimi za svoje delovanje potrebujejo kofaktorje. Glavna funkcija aktivnega mesta je zmanjšati aktivacijsko energijo kemične reakcije in s tem povečati hitrost reakcije.
Kaj je vezavno mesto?
Vezivno mesto je regija na proteinu, DNK ali RNK, na katero se lahko vežejo ligandi. Tam lahko ligand tvori kemično vez s tem mestom. Te regije kažejo specifičnost; določen ligand se bo vezal na določeno vezavno mesto. Zato je to mesto merilo vrst ligandov, ki se lahko vežejo z molekulo.
Poleg tega te regije pogosto uporabljamo za funkcionalno karakterizacijo biomolekul. Na primer, lahko označimo funkcionalnost aktivnega mesta prek njegovega veznega mesta. Poleg tega je v primeru DNK posebna vrsta vezavnega mesta vezavno mesto transkripcijskega faktorja, ki je prisotno na DNK.
Kakšna je razlika med aktivnim in veznim mestom?
Aktivno mesto je regija na encimu, na katero se vežejo substrati kemične reakcije, da pride do katalizirane kemične reakcije, medtem ko je vezavno mesto regija na proteinu, DNK ali RNK, na katero se lahko vežejo ligandi. To je ključna razlika med aktivnim in veznim mestom. Poleg tega so aktivna mesta prisotna na encimih in pomagajo povečati hitrost reakcije določene kemične reakcije z zmanjšanjem aktivacijske energetske pregrade te reakcije. Vezavna mesta pa so odgovorna za vezavo specifičnega liganda z določeno molekulo.
Spodnja infografika prikazuje razliko med aktivnim in veznim mestom v obliki tabele.
Povzetek – Aktivno mesto proti zavezujočemu mestu
Aktivna mesta so področja na encimih, ki lahko povečajo reakcijsko hitrost kemijske reakcije z zmanjšanjem aktivacijske energetske pregrade te reakcije. Vezavno mesto je katera koli regija, na katero se lahko veže ligand. Aktivno mesto vsebuje tudi vezavno mesto. Razlika med aktivnim mestom in veznimi mesti je v obstoju in funkcionalnosti. Zato je ključna razlika med aktivnim in vezavnim mestom ta, da aktivno mesto pomaga pri katalizi kemične reakcije, medtem ko vezavno mesto pomaga pri vezavi liganda na veliko molekulo.