Ključna razlika med največjo skromnostjo in največjo verjetnostjo je odvisna od metode, uporabljene pri razvoju filogenetskega drevesa. Največja varčnost se osredotoča na minimiziranje skupnih stanj znakov med konstrukcijo filogenetskega drevesa, medtem ko je največja verjetnost statistični pristop pri risanju filogenetskega drevesa, odvisno od verjetnosti med genetskimi podatki.
Filogenija je nov pristop k klasifikaciji in nomenklaturi organizmov. Filogenija temelji na genetskih podatkih in evolucijskih odnosih. Genetski podatki so rezultat sekvenciranja DNK. V filogeniji poteka klasifikacija organizmov na podlagi skupnega prednika. Največja skromnost in največja verjetnost filogenetskega razmerja povečata natančnost in zanesljivost filogenetskega drevesa.
Kaj je največja varčnost?
Pri tehniki maksimalne varčnosti pride do minimiziranja skupnih sprememb stanja karakterja med filogenetsko analizo. Filogenetika je veja biologije, ki se ukvarja s preučevanjem evolucijskih odnosov. Filogenetsko drevo je drevo, ki prikazuje evolucijska razmerja na podlagi skupnega prednika. Tako je pri risanju filogenetskega drevesa z uporabo koncepta največje skromnosti količina vzporedne evolucije čim manjša. Zato bo največja varčnost ustvarila drevo veliko hitreje kot druge metode. To je zato, ker so samo glavne značilnosti, ki se razlikujejo, upoštevane v največji možni meri.
Slika 01: Največja parsimonija
Ko rišemo maksimalno varčno drevo, je drevo vedno najkrajše možno drevo z najmanjšim številom taksonov. Vendar pa je zanesljivost največjega varčnega drevesa zelo visoka. Statistična doslednost in natančnost filogenetskega razmerja, ki temelji na največji skromnosti, se bosta razlikovali. Poleg tega obstajajo zapleteni algoritmi, ki analizirajo največjo skromnost filogenetskega razmerja.
Kaj je največja verjetnost?
Maksimalna verjetnost je ena najpogosteje uporabljenih statističnih metod, ki analizira filogenetske odnose. Metoda bo analizirala filogenijo na podlagi verjetnostnega modela. Poleg tega ta metoda upošteva povprečje in varianco. Tako je v filogeniji največja verjetnost dosežena na podlagi danih genetskih podatkov določenega organizma.
Slika 02: Največja verjetnost
Uporaba statistične metode največje verjetnosti ima tako prednosti kot slabosti. Metoda je zelo primerna pri analizi enostavnega niza podatkov, ki vsebuje genetske informacije. Ko je stopnja variance med genetskimi podatki nižja, so rezultati največje verjetnosti zanesljivi. Rezultati, ustvarjeni z največjo verjetnostjo, nadalje potrjujejo najvišje ocene parsimonije določenega filogenetskega razmerja. Zato analiza največje verjetnosti deluje kot potrditveni test.
V primerjavi z zgoraj omenjenimi prednostmi je ta metoda počasen in intenziven proces. Poleg tega je v odsotnosti enotnega nabora podatkov izhod napak visok. Tako tudi otežuje ponovljivost rezultatov z oceno največje verjetnosti.
Kakšne so podobnosti med največjo skromnostjo in največjo verjetnostjo?
- Maksimalna skromnost in največja verjetnost sta dva pristopa, ki igrata pomembno vlogo v filogeniji.
- Obe tehniki prikazujeta odnos organizma do njegovega prednika na podlagi razpoložljivih genetskih podatkov.
- Filogenetska drevesa je mogoče razlagati z uporabo največje skromnosti in največje verjetnosti.
- Pri obeh tehnikah se genetski podatki opirajo na sekvenciranje DNK ali RNK.
- Obe metodi sta pomembni pri ustvarjanju filogenetskih dreves.
Kakšna je razlika med največjo skromnostjo in največjo verjetnostjo?
Tako največja varčnost kot največja verjetnost sta dva različna pristopa pri interpretaciji filogenetskega drevesa. Največja varčnost verjame v analizo nekaj značilnosti in minimiziranje značajskih sprememb od organizma do organizma. Nasprotno pa metoda največje verjetnosti upošteva povprečje in varianco ter pridobi največjo verjetnost na podlagi danih genetskih podatkov določenega organizma. Torej, to je ključna razlika med največjo varčnostjo in največjo verjetnostjo.
Poleg tega samo zanesljivost največje skromnosti ni zadostna za izpeljavo sklepa. Toda metoda največje verjetnosti deluje kot potrditveni test rezultatov največje skromnosti. Zato je treba sklepati z uporabo največje skromnosti in največje verjetnosti.
Spodnja infografika povzema razliko med največjo skromnostjo in največjo verjetnostjo.
Povzetek – Največja skromnost v primerjavi z največjo verjetnostjo
Filogenija igra pomembno vlogo pri izpeljavi evolucijskih odnosov s konstruiranjem filogenetskih dreves. Največja varčnost je tehnika konstruiranja drevesa z najmanjšim številom sprememb stanja znakov. Nasprotno pa največja verjetnost filogenetskega drevesa temelji na uporabi največje podobnosti med genetskimi podatki. Podatki za obe analizi izhajajo iz podatkov o zaporedju DNA ali RNA. Zanesljivost in natančnost sta visoki, če konstrukcija drevesa poteka z uporabo obeh tehnik. To torej povzema razliko med največjo skromnostjo in največjo verjetnostjo.
