Ključna razlika med ORF in eksonom je, da je ORF ali odprti bralni okvir odsek zaporedja DNK, ki se začne z mestom iniciacije prevoda (začetni kodon) in konča z mestom zaključka prevoda (kodon za zaustavitev), medtem ko je ekson nukleotidno zaporedje znotraj gena, ki kodira aminokisline.
Odprti bralni okvir je del bralnega okvirja. Bralne okvirje berejo ribosomi, da tvorijo beljakovine. ORF je neprekinjen odsek kodonov, ki daje popolnoma funkcionalen protein. Začne se z začetnim kodonom in konča s stop kodonom. Znotraj ORF ni stop kodona, ki bi prekinil kodirno zaporedje. Translacija se začne pri začetnem kodonu in konča pri stop kodonu. Ekson je nukleotidno zaporedje gena. Kodira aminokisline beljakovin. Zato so eksoni kodirne regije gena.
Kaj je ORF?
Odprti bralni okvir ali ORF je neprekinjen odsek nukleotidnega zaporedja, ki se začne z začetnim kodonom in konča s stop kodonom. Preprosto povedano, ORF se nanaša na regijo nukleotidnega zaporedja, ki se nahaja med začetnim in končnim kodonom. Vmes ni stop kodona, ki bi prekinil ORF. Nukleotidno zaporedje med začetnim in končnim kodonom kodira aminokisline. Na splošno je začetni kodon ATG, medtem ko so stop kodoni TAG, TAA in TGA. ORF daje funkcionalni protein, ko se prepisuje in prevaja. Zato ORF vključuje začetni kodon, več kodonov v srednji regiji in stop kodon. Zanimivo je, da ima ORF dolžino, ki jo lahko delimo s tri.
Slika 01: ORF
Ker pri prokariontih ni intronov, je ORF kodirna regija gena, ki se prepisuje neposredno v mRNA. Pri evkariontih, ker obstajajo introni, je ORF zaporedje kodona, ki nastane po obdelavi ali spajanju RNA. ORF je dokaz, ki pomaga pri napovedovanju genov, saj so dolgi ORF verjetno del gena.
Kaj je ekson?
Egzoni so kodirajoča nukleotidna zaporedja genov, ki se prevajajo v beljakovine. Nahajajo se na obeh straneh introna. Po odstranitvi nekodirajočih zaporedij iz pre mRNA, zrela molekula mRNA obsega samo zaporedja eksona. Nato se nukleotidno zaporedje končne molekule RNA (zrela mRNA) pretvori v aminokislinsko zaporedje določenega proteina.
Slika 02: Eksoni
Skoraj vsi geni imajo začetno nukleotidno zaporedje, ki ga loči kot gen od glavne verige DNK ali RNK, ki je znano kot odprt bralni okvir (ORF). V nekaterih genih dva ORF označujeta celoten gen in eksone se nahajajo znotraj kodirajočega zaporedja. Čeprav se zdi, da so eksoni vedno izraženi v genih, obstajajo primeri, ko zaporedja intronov posegajo v ekson, da povzročijo mutacije, in ta proces je znan kot eksonizacija.
Kakšne so podobnosti med ORF in Exonom?
- Tako ORF kot ekson sta nukleotidna zaporedja.
- Dolgi ORF in eksoni so deli gena.
- Obe imata zaporedja kodiranja.
Kakšna je razlika med ORF in Exonom?
ORF in ekson sta nukleotidna zaporedja. ORF se nanaša na kateri koli odsek zaporedja DNA, ki se nahaja med začetnim kodonom in stop kodonom. Nasprotno pa je ekson kodirno nukleotidno zaporedje gena, ki kodira aminokisline. To je torej ključna razlika med ORF in eksonom. Eksoni so deli gena, medtem ko je dolgi ORF verjetno del gena. Poleg tega so introni na obeh straneh eksona, medtem ko ORF ne vključuje intronov.
Spodnja infografika povzema razliko med ORF in eksonom v obliki tabele.
Povzetek – ORF proti Exonu
Odprti bralni okvir (ORF) je del bralnega okvirja. To je neprekinjen odsek zaporedja DNK, ki se začne z začetnim kodonom in konča s stop kodonom. Ekson je nukleotidno zaporedje gena. Kodira del zaporedja mRNA. Zato so eksoni deli genskega zaporedja, ki se izražajo v beljakovini. To torej povzema razliko med ORF in eksonom.
