Ključna razlika – DNK navzgor in navzdol
Pomembno je imeti splošno znanje o sestavi in strukturi DNK, da bi razumeli razliko med DNK navzgor in navzdol. DNK je sestavljena iz polinukleotidnih verig. Nukleotidi so gradniki, ki ustvarjajo polinukleotidne verige in vsak nukleotid je sestavljen iz treh komponent: sladkorja s petimi ogljikovimi atomi, dušikove baze in fosfatne skupine. Fosfatna skupina in OH skupina sta vezani na 5' položaj ogljika oziroma 3' položaj ogljika molekule sladkorja v nukleotidu. Nukleotidi so povezani s fosfodiestrskimi vezmi, ki nastanejo med 5' fosfatno skupino enega nukleotida in 3' OH skupino sosednjega nukleotida. Če ima polinukleotidna veriga prosto 5' fosfatno skupino, je dodeljena kot 5' konec; če ima prosto 3' OH skupino, je dodeljen kot 3' konec. Zato imajo verige DNK običajno 5' in 3' konce glede na končne položaje polinukleotidnih verig. DNK obstaja tudi kot dvoverižna oblika. Dve niti sta antiparalelni drug drugemu. Zato ima DNK dve verigi, ki potekata v smeri od 5' do 3' in od 3' do 5'. DNK navzgor in navzdol se nanaša na transkripcijo in sintezo 5' do 3' verige mRNA. Če se DNK obravnava proti koncu kodirne verige od mesta iniciacije transkripcije, je znana kot DNK navzgor. Če se DNK obravnava proti 3' koncu od kodirne verige od mesta iniciacije transkripcije, je to znano kot DNK navzdol. To je ključna razlika med DNK navzgor in navzdol.
Kaj je upstream DNK?
Gen je strukturna in funkcionalna enota dednosti, ki se nahaja na DNK organizma. Shranjen je z navodili za izdelavo proteina. Gen ima specifično regijo molekule DNA. Po potrebi se prepiše in prevede v protein s sintezo verige mRNA. Običajno poteka kodirna veriga gena od 5' do 3' smeri. Ko se prepisuje, proizvede verigo mRNA v isti smeri 5' do 3'. Med transkripcijo 3' do 5' protismiselna veriga služi kot vzorčna veriga in sproži sintezo mRNA. V genu je mesto iniciacije transkripcije. Glede na mesto iniciacije transkripcije je regija DNA proti 5' koncu kodirne verige znana kot DNK navzgor. Promotor gena se običajno nahaja v zgornji regiji DNK. V evkariontskih genih obstajajo škatle TATA, proksimalni elementi promotorja in ojačevalci v območju navzgor od gena. Gornje območje gena je označeno z negativnimi številkami. DNK gena navzgor je izjemnega pomena za transkripcijo.
Kaj je Downstream DNK?
Mesto iniciacije transkripcije je znano kot +1 točka gena. Območje DNK od točke +1 proti 3' koncu kodirne verige je znano kot DNK navzdol. Z drugimi besedami, dolvodno od gena je od mesta iniciacije transkripcije proti 5' koncu vzorčne verige. Zato nadaljnja DNK genske regije vključuje transkripcijsko enoto in druga zaporedja, kot je terminatorsko zaporedje. Promotor lahko vpliva na zaporedje gena navzdol. Nizvodni del gena je označen s pozitivnimi številkami. Naslednja DNK gena je dejanska regija, ki daje beljakovinski produkt.
Slika 01: DNK navzgor in navzdol
Kakšna je razlika med DNK navzgor in navzdol?
DNK navzgor in navzdol |
|
| Območje DNK proti 5' koncu kodirnega zaporedja od iniciacijskega mesta transkripcije je znano kot navzgornja DNK. | Območje DNK proti 3' koncu kodirne verige od mesta iniciacije transkripcije je znano kot DNK navzdol. |
| Elementi | |
| Promotorji in ojačevalci se nahajajo na zgornji DNK | Transkripcijska enota in terminatorska zaporedja se nahajajo v spodnji DNK. |
| Številčenje | |
| Nukleotidi v zgornji regiji so označeni z negativnimi številkami | Nukleotidi so označeni s pozitivnimi številkami. |
| Funkcija | |
| Ta regija vsebuje elemente, potrebne za uravnavanje in začetek prepisovanja | Ta regija vsebuje navodila za proizvodnjo proteina in prekinitev transkripcije |
Povzetek – DNK navzgor in navzdol
Preprosto je prepoznati navzgor in navzdol od verige RNA. Kar zadeva referenčno mesto, je regija proti 5' koncu verige RNA znana kot gorvodna RNA, medtem ko je regija proti 3' koncu znana kot dolvodna RNA. Vendar pa v DNK obstajata dve verigi, ki potekata v obe smeri 5' proti 3' in 3' proti 5'. Zato je razlika med DNK navzgor in navzdol zapletena. Zato se razlikuje glede na transkripcijo gena. Od mesta iniciacije transkripcije proti koncu 5 zaznavne verige je regija DNA znana kot DNA navzgor, medtem ko je od mesta iniciacije prepisovanja proti koncu 3' zaznavne verige znana kot DNA navzdol. To je razlika med DNK navzgor in navzdol.
