Ključna razlika med oligopeptidom in polipeptidom je v tem, da oligopeptidi vsebujejo malo aminokislinskih ostankov, medtem ko polipeptidi vsebujejo veliko število aminokislinskih ostankov.
Izraza oligopeptidi in polipeptidi spadata v kategorijo beljakovin. Peptidi so kratke verige aminokislin. Aminokisline se med seboj vežejo preko peptidnih vezi. Zato lahko te peptide kategoriziramo glede na število aminokislin, prisotnih v teh peptidih. Npr. dipeptidi, tripeptidi, tetrapeptidi, oligopeptidi in polipeptidi.
Kaj je oligopeptid?
Oligopeptid je veriga aminokislin, ki vsebuje majhno število aminokislin na molekulo. Te molekule pogosto imenujemo "peptidi" kot splošni izraz. Število aminokislinskih ostankov v teh peptidnih molekulah se lahko giblje od dveh do dvajsetih aminokislin. Oligopeptidi lahko vključujejo tudi nekatere majhne peptidne oblike, kot so dipeptidi, tripeptidi itd. Nekateri pogosti primeri naravno prisotnih oligopeptidov vključujejo mikroviridin, cianopeptoline, mikrocistine itd.
Slika 01: Struktura tripeptida
Te oligopeptide proizvajajo sintaze neribosomskih peptidov ali NRPS. Vendar obstaja nekaj izjem. Na primer, ciklamidi in mikroviridin se sintetizirajo po ribosomskih poteh. Postopek izolacije oligopeptidov vključuje obogatitev, čiščenje in identifikacijo oligopeptidov. Za postopek identifikacije lahko uporabimo gelsko kromatografijo, HPLC, HPLC-masno spektroskopijo, ionsko izmenjevalno kromatografijo itd.
Kaj je polipeptid
Polipeptid je veriga aminokislinskih ostankov, ki vsebujejo veliko število aminokislin. Protein vsebuje eno ali več polipeptidnih verig. V teh polipeptidnih verigah so aminokisline med seboj povezane s peptidnimi vezmi, ki so vrsta kovalentnih kemičnih vezi. Vsaka polipeptidna veriga vsebuje dva konca: N-terminal in C-terminal. N-terminal je amino-terminal, ki se konča s prosto amino skupino, medtem ko je C-terminal karboksilni terminal, ki se konča s prosto karboksilno skupino. Zaporedje aminokislin, prisotnih v peptidu, je določeno s kodoni v mRNA, ki so vključeni v proizvodnjo polipeptida ali proteina s prevajanjem vzorčne verige.
Glede na število in razporeditev polipeptidov v beljakovini obstajajo štiri glavne vrste beljakovinskih struktur, kot sledi:
- Primarna struktura – Primarna struktura proteina vsebuje eno samo polipeptidno verigo, ki ima disulfidne mostove med nekaterimi aminokislinami v isti verigi, kar tvori prepognjeno strukturo.
- Sekundarna struktura – Sekundarna struktura proteina ima dve glavni obliki: strukturo alfa-vijačnice in strukturo beta-listov.
Slika 02: Struktura alfa vijačnice
- Terciarna struktura – To je visoko nagubana mrežna struktura. Ta struktura je zelo pomembna, saj določa delovanje beljakovine.
- Kvartarna struktura – To je zelo zapletena struktura dveh ali treh polipeptidnih verig, ki so med seboj povezane.
Kakšna je razlika med oligopeptidom in polipeptidom?
Oligopeptidi in polipeptidi sta dve različni kategoriji beljakovin. Med seboj se razlikujejo glede na število aminokislinskih ostankov, ki so prisotni v beljakovinskih molekulah. Zato je ključna razlika med oligopeptidom in polipeptidom ta, da oligopeptidi vsebujejo malo aminokislinskih ostankov, medtem ko polipeptidi vsebujejo veliko število aminokislinskih ostankov.
Spodnja infografika povzema razliko med oligopeptidom in polipeptidom.
Povzetek – Oligopeptid proti polipeptidu
Oligopeptidi in polipeptidi sta dve različni kategoriji beljakovin. Med seboj se razlikujejo glede na število aminokislinskih ostankov v teh beljakovinskih molekulah. To pomeni, da je ključna razlika med oligopeptidom in polipeptidom ta, da oligopeptidi vsebujejo malo aminokislinskih ostankov, medtem ko polipeptidi vsebujejo veliko število aminokislinskih ostankov.
