Ključna razlika med kandidatnim genom in GWAS je, da pristop s kandidatnim genom raziskuje genetske variacije znotraj majhnega števila vnaprej določenih zanimivih genov, medtem ko GWAS raziskuje celoten genom za skupno genetsko variacijo v ozadju določene bolezni.
Pristop genov kandidatov in študije povezav celotnega genoma (GWAS) sta dve metodi, ki sta pomembni za odkrivanje genetske dovzetnosti za bolezni. Pristop genov kandidatov temelji na vnaprej določenem majhnem številu genov, medtem ko GWAS temelji na testiranju celotnega genoma. Zato pristop kandidatnega gena zahteva predhodno poznavanje genov, ki so pomembni za bolezen, za razliko od GWAS.
Kaj je kandidatni gen?
Pristop genov kandidatov je ena od tehnik, ki raziskuje povezavo med genetskimi variacijami znotraj vnaprej določenih zanimivih genov in fenotipi ali bolezenskimi stanji. Pri tem pristopu je potrebno predhodno znanje o biološkem funkcionalnem vplivu gena na zadevno lastnost ali bolezen. Na podlagi tega znanja se izbere majhno število genov in analizira genetske variacije.
Slika 01: Pristop genskega kandidata
Izbira genov je narejena na podlagi biološkega, fiziološkega in funkcionalnega pomena za zadevno bolezen v tem pristopu. Ta pristop je pogosto zasnovan kot študija primera in kontrole.
Kaj je GWAS?
GWAS je kratica za Genome-Wide Association Study. Nanaša se tudi na študije povezav celotnega genoma. Te študije se osredotočajo predvsem na opazovalne študije. Analizirajo genetske različice različnih posameznikov, ki so običajno povezane z določeno lastnostjo. Za analizo GWAS je pomemben celoten genom.
GWAS je pomembno orodje pri analizi polimorfizmov enega nukleotida, povezanih z različnimi boleznimi. Je primerjalna študija različnih polimorfizmov enega nukleotida v široki populaciji. Študijski vzorec GWAS je zelo visok; zato ima tudi obliko presečne kohortne študije.
Slika 02: GWAS
Prva študija GWAS je potekala v zvezi z miokardnim infarktom in analizo genov, povezanih z miokardnim infarktom. GWAS ima trenutno pomembno vlogo pri določanju genetskega ozadja zapletenih bolezni z neznano etiologijo.
Kakšne so podobnosti med kandidatnim genom in GWAS?
- Tako genski pristop kandidata kot GWAS sta tehniki, ki analizirata genetsko povezavo med genotipom in fenotipom bolezni.
- Oba pristopa pomagata razumeti genetsko osnovo dovzetnosti za bolezni.
Kakšna je razlika med kandidatnim genom in GWAS?
Pristop genov kandidatov temelji na genih kandidatov ali vnaprej določenih genih, medtem ko GWAS temelji na celotnem genomu. Torej, to je ključna razlika med kandidatnim genom in GWAS. Tudi pri pristopu kandidatnih genov je izbor genov nujen, medtem ko pri GWAS ni potreben.
Poleg tega pristop k kandidatnemu genu zahteva predhodno znanje o genih, pomembnih za bolezen, medtem ko za GWAS ni potreben.
Spodnja infografika ponuja podrobnejšo primerjavo v zvezi z razliko med kandidatnim genom in GWAS.
Povzetek – Kandidatni gen proti GWAS
Gen kandidata in GWAS sta dve študiji povezovanja genov. Pristop genov kandidatov se osredotoča na genetske variacije, povezane z boleznijo znotraj majhnega števila vnaprej določenih genov. Nasprotno pa GWAS raziskuje genetske variacije, povezane z boleznijo, znotraj celotnega genoma. Torej, to je ključna razlika med kandidatnim genom in GWAS. Obe metodi sta pomembni pri razumevanju genetske osnove dovzetnosti za bolezni.
