Ključna razlika med snRNA in snoRNA je, da snRNA vključuje alternativno spajanje pre-mRNA, medtem ko snoRNA vključuje spreminjanje rRNA in tRNA, urejanje mRNA in vtiskovanje genoma.
Male RNA so polimerne molekule RNA, ki so sestavljene iz manj kot 200 nukleotidov. Običajno niso kodirani. Obstajajo med messenger RNA za prenašanje signalov. Majhne RNA izvirajo iz popolne dvoverižne RNA, ki nastane z delovanjem od RNA odvisne RNA polimeraze. Majhne RNA igrajo pomembno vlogo pri celični diferenciaciji, rasti in proliferaciji, apoptozi, metabolizmu, migraciji in obrambi. Zato so majhne RNA pomembni in kritični regulatorji razvoja in fiziologije. Mala jedrna RNA in majhna nukleolarna RNA sta dva razreda majhnih molekul RNA.
Kaj je snRNA?
Mala jedrska RNA ali snRNA je razred majhnih molekul RNA, ki jih najdemo v jedru evkariontskih celic. Povprečna dolžina snRNA je približno 150 nukleotidov. RNA polimeraza II ali RNA polimeraza III prepisuje snRNA. Glavna funkcija snRNA je procesiranje predmesenger RNA v jedru. Pomagajo tudi pri uravnavanju transkripcijskih faktorjev ali RNA polimeraze II in ohranjajo telomere.
Slika 01: Mehanizem delovanja majhne RNA
Obstajata dva razreda snRNA, ki temeljita na skupnih značilnostih zaporedja in povezanih proteinskih dejavnikih, kot je protein LSm, ki veže RNK. Dva razreda sta snRNA razreda Sm in snRNA razreda Lsm. SnRNA razreda Sm je sestavljena iz visokih vsebnosti uridina U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 in U12. RNA polimeraza II prepisuje snRNA razreda SM. Po transkripciji pre-snRNA običajno prejmejo 7-metilgvanozin 5' kapico v jedru. Nato se skozi jedrske pore izvozijo v citoplazmo za nadaljnjo obdelavo. SnRNA razreda Lsm ima visoko vsebnost uridina U6 in U6atac. RNA polimeraza III prepisuje snRNA razreda Lsm in ne zapusti jedra. Najpogostejše komponente človeške snRNA so U1 spliceosomalna RNA, U2 spliceosomalna RNA, U4 spliceosomalna RNA, U5 spliceosomalna RNA in U6 spliceosomalna RNA.
Kaj je snoRNA?
Mala nukleolarna RNA ali snoRNA je razred majhnih molekul RNA, ki vodijo kemične modifikacije v drugi RNA, kot je ribosomska RNA, prenosna RNA in majhna jedrska RNA. Vsaka molekula snoRNA je med procesom modifikacije povezana s približno štirimi jedrnimi proteini v kompleksu RNA/protein. SnoRNA vsebuje protismiselni element, ki obsega približno 10-20 nukleotidov. Te baze so komplementarne zaporedju, ki obdaja nukleotide, ki ciljajo na modifikacijo v molekuli pre-RNA.
Slika 02: Mala nukleolarna RNA
Obstajata dva razreda snoRNA. To sta C/D box snoRNA in H/ACA box snoRNA. C/D box snoRNA je povezana z metilacijo, H/ACA box snoRNA pa s psevdouridilacijo. Vsaka molekula snoRNA deluje kot vodilo za eno ali dve modifikaciji ciljne RNA. C/D box snoRNA vsebuje dva kratka ohranjena zaporedna motiva C in D, blizu 5' oziroma 3' koncev snoRNA. Kratke regije, sestavljene iz 5 nukleotidov, so razporejene navzgor od polja C in navzdol od polja D ter tvorijo strukturo stebla. To približa motiva polja C in D. Struktura matične škatle je pomembna za pravilno sintezo snoRNA in nukleolarno lokalizacijo. H/ACA box snoRNA ima sekundarno strukturo, ki je sestavljena iz dveh lasnic in dveh enoverižnih regij. To je splošno znano kot struktura lasnica-tečaj-lasnica-rep. H/ACA box snoRNA je prav tako sestavljena iz dveh ohranjenih motivov H in ACA. Oba se nahajata v enoverižnih regijah. Polje H je v tečaju, ACA pa v predelu repa. Trije nukleotidi tvorijo 3' konec zaporedja.
Kakšne so podobnosti med snRNA in snoRNA?
- snRNA in snoRNA sta majhni RNA.
- Oboje je prisotno v evkariontskih celicah.
- Obe sta nekodirajoči molekuli RNA.
- Poleg tega sodelujejo pri spreminjanju RNA med procesom prepisovanja.
Kakšna je razlika med snRNA in snoRNA?
snRNA sodeluje pri alternativnem spajanju pre-mRNA, medtem ko snoRNA v glavnem modificira molekule RNA. Tako je to ključna razlika med snRNA in snoRNA. Poleg tega so snRNA dolge približno 150 nukleotidov in jih pogosto najdemo povezane s skupino proteinov in kompleksov, imenovanih majhni jedrski ribonukleoproteini. snoRNA so dolge približno 60-170 nukleotidov in se večinoma nahajajo v nukleolu.
Poleg tega se snRNA prepisuje bodisi z RNA polimerazo II ali RNA polimerazo III, medtem ko se snoRNA prepisuje samo z RNA polimerazo II.
Spodnja infografika predstavlja razlike med snRNA in snoRNA v obliki tabele za vzporedno primerjavo.
Povzetek – snRNA proti snoRNA
snRNA in snoRNA sta razreda majhnih molekul RNA. snRNA sodeluje pri alternativnem spajanju pre-mRNA, medtem ko snoRNA v glavnem modificira molekule RNA. Tako je to ključna razlika med snRNA in snoRNA. Majhne RNA so polimerne molekule RNA, ki so sestavljene iz manj kot 200 nukleotidov v dolžino in so običajno nekodirajoče. snRNA se nahajajo v jedru evkariontov. snoRNA najdemo v arhejah in evkariontih. Transkripcija snRNA poteka preko RNA polimeraze II in II, medtem ko pri prepisovanju snoRNA sodeluje samo RNA polimeraza II. Torej, to povzema razliko med snRNA in snoRNA.
