Ključna razlika – ukoreninjeno in neukoreninjeno filogenetsko drevo
Filogenija je pomembno področje, ki raziskuje življenje na zemlji skozi čas. Razkriva povezanost organizmov z njihovimi predniki in potomci. Odnosi med organizmi so diagramsko predstavljeni z različnimi drevesnimi prikazi, kot so dendogram, kladogram, fenogram, filogram itd. Filogenetsko drevo je razvejan drevesni diagram, ki razlaga filogenetske odnose med organizmi z obsegom evolucijske razdalje. Obstajata dve glavni vrsti filogenetskih dreves, znanih kot ukoreninjena in neukoreninjena. Ključna razlika med ukoreninjenim in neukoreninjenim filogenetskim drevesom je v tem, da ukoreninjeno drevo prikazuje najbolj bazalnega prednika drevesa, medtem ko neukoreninjeno filogenetsko drevo ne kaže predniške korenine.
Kaj je ukoreninjeno filogenetsko drevo?
Ukoreninjeno filogenetsko drevo služi kot uporaben diagram, ki prikazuje evolucijsko zgodovino. Ima bazalno vozlišče, ki se imenuje koren in predstavlja skupnega prednika vseh skupin drevesa. Koren drevesa velja za najstarejšo točko v drevesu, ki predstavlja zadnjega skupnega prednika vseh skupin, vključenih v drevo. Zato ukoreninjeno drevo kaže smer evolucijskega časa. Iz ene vrste ukoreninjenega drevesa je mogoče najti skupno poreklo ali prednika vrste s sledenjem nazaj do bazalnega vozla. Ker ukoreninjeno drevo prikazuje smer evolucijskega časa, je zlahka najti starejše ali novejše skupine, ki jih ima. Ukoreninjeno drevo se lahko uporablja za preučevanje celih skupin organizmov. Natančno ukoreninjenje filogenetskega drevesa je pomemben in ključen dejavnik, saj lahko nenatančno ukoreninjenje povzroči napačne interpretacije genetskih sprememb med organizmi in njihovo usmerjenost evolucije.
Slika 01: Ukoreninjeno filogenetsko drevo
Kaj je neukoreninjeno filogenetsko drevo?
Neukoreninjeno filogenetsko drevo je filogenetski diagram, ki nima skupnega prednika ali bazalnega vozla. Ta vrsta drevesa ne nakazuje izvora evolucije interesnih skupin. Prikazuje samo odnos med organizmi ne glede na smer evolucijske časovne premice. Zato je težko proučevati evolucijska razmerja skupin glede na čas z uporabo neukoreninjenega drevesa.
Obstajata dva glavna načina za ukoreninjenje neukoreninjenega filogenetskega drevesa. So
Iskanje zunanje skupine – To zahteva predhodno znanje o odnosih med taksoni. Potem se lahko takson, ki leži zunaj skupine, uporabi kot zunanja skupina za risanje ukoreninjenega filogenetskega drevesa
Iskanje sredine ali razdalje – Središče dveh najbolj oddaljenih taksonov v drevesu se lahko domneva kot koren za filogenetsko drevo
Slika 02: Neukoreninjeno filogenetsko drevo
Kakšna je razlika med ukoreninjenim in neukoreninjenim filogenetskim drevesom?
Ukoreninjeno proti neukoreninjenemu filogenetskemu drevesu |
|
| Ukoreninjeno filogenetsko drevo je diagram, ki prikazuje zadnjega skupnega prednika skupin. | Neukoreninjeno filogenetsko drevo prikazuje odnose med organizmi brez prikaza skupnega prednika. |
| Node | |
| Ima vozlišče (root). | Nima vozlišča. |
| Smer evolucije | |
| Ima smer, ki označuje evolucijski čas. | Ne navaja evolucijskega odnosa. |
| Odnos do drugih | |
| Drevo omogoča določanje razmerja prednik – potomec med skupinami. | Drevo ne dovoljuje govoriti o razmerju prednik – potomec. |
Povzetek – ukoreninjeno proti neukoreninjenemu filogenetskemu drevesu
Filogenetsko drevo predstavlja evolucijske poti in povezave med organizmi z uporabo razvejanih drevesnih diagramov. Filogenetska tresava je lahko ukoreninjena ali neukoreninjena. Ukoreninjeno drevo ima na dnu vozlišče, ki predstavlja skupnega prednika, ki povezuje vse interesne skupine. Neukoreninjeno drevo prikazuje odnose med organizmi. Vendar pa ne prikazuje skupnega prednika, ki si ga delijo vse skupine. To je razlika med ukoreninjenim in neukoreninjenim filogenetskim drevesom.
