Ključna razlika med sigma faktorjem in rho faktorjem je, da je sigma faktor beljakovina, ki je potrebna za začetek transkripcije v bakterijah, medtem ko je rho faktor beljakovina, ki je potrebna za prekinitev transkripcije v bakterijah.
Sigma faktor in rho faktor sta dva pomembna dejavnika za bakterijsko prepisovanje. Bakterijska transkripcija je proces, pri katerem se delček bakterijske DNA kopira v novo izdelano verigo mRNA (messenger RNA). Ta proces katalizira encim, znan kot RNA polimeraza. Bakterije so močno odvisne od prepisovanja in prevajanja, da se pravilno odzovejo na svoje okolje. Bakterijska RNA polimeraza je sestavljena iz jedra in holoencimske strukture. Jedro vsebuje podenote β, β', α in 2ω, medtem ko holoencim vsebuje sigma faktor. Poleg tega je za bakterijsko prepisovanje zelo pomemben tudi pomožni faktor RNA polimeraze, znan kot rho faktor.
Kaj je Sigma Factor?
Sigma faktor ali faktor specifičnosti je protein, potreben za začetek transkripcije v bakterijah. Je bakterijski faktor iniciacije transkripcije. Ta faktor omogoča vezavo encima RNA polimeraze na specifično regijo DNA, imenovano promotorska regija med transkripcijo. Sigma faktor je običajno homologen arhealnemu transkripcijskemu faktorju B in evkariontskemu transkripcijskemu faktorju TF11B. Poleg tega se specifični sigma faktor danega gena razlikuje glede na gen in okoljske signale. Promotorje izbere RNA polimeraza glede na faktor sigma, ki je z njo povezan.
Slika 01: Sigma faktor
Faktor sigma lahko najdemo tudi v kloroplastih rastlin kot del plastidno kodirane polimeraze (PEP). Sigma faktor in RNA polimeraza skupaj sta znana kot holoencim RNA polimeraze. Molekulska masa sigma faktorja je okoli 70 kDa. Po začetku transkripcije se faktor sigma loči od kompleksa. Nato RNA polimeraza nadaljuje elongacijo, dokler se transkripcija ne konča.
Kaj je Rho faktor?
Faktor Rho je prokariontski protein, ki sodeluje pri terminaciji transkripcije. Faktor Rho se običajno veže na mesto pavze terminatorja transkripcije. To mesto je izpostavljena regija enoverižne RNA v bližini odprtega bralnega okvirja pri zaporedjih, ki so bogata s citozinom in revna z gvaninom. Je esencialni transkripcijski protein pri prokariontih. Pri Escherichia coli je rho faktor približno 274,6 kDa heksamer identičnih podenot. Vsaka podenota ima vezavno domeno RNA in domeno hidrolize ATP. Poleg tega je funkcija rho faktorja aktivnost helikaze.
Slika 02: Rho faktor
Faktor Rho se veže na molekulo RNA in nato uporabi svojo aktivnost ATPaze za zagotavljanje energije za premeščanje molekul RNA. Rho faktor izvaja translokacijo, dokler ne doseže vijačne regije RNA-DNA, kjer odvije hibridno (RNA-DNA) dupleks strukturo. Ta proces zaustavi polimerazo RNA na terminacijskem mestu, s čimer se prekine proces prepisovanja.
Kakšne so podobnosti med faktorjem Sigma in faktorjem Rho?
- Faktor sigma in faktor rho sta dva pomembna dejavnika za bakterijsko prepisovanje.
- Oboje je prisotno le pri prokariontih.
- So beljakovine, sestavljene iz aminokislin.
- Oba sta proteina, ki vežeta nukleinske kisline.
- Prokarionti so močno odvisni od teh dejavnikov, da ustvarijo mRNA, ki lahko izdeluje posebne beljakovine in jim pomaga, da se specifično odzovejo na okolje.
Kakšna je razlika med faktorjem Sigma in Rho faktorjem?
Sigma faktor je protein, potreben za začetek transkripcije v bakterijah, medtem ko je rho faktor protein, potreben za zaključek transkripcije v bakterijah. Torej, to je ključna razlika med faktorjem sigma in faktorjem rho. Poleg tega je sigma faktor protein, ki veže DNA, medtem ko je faktor rho protein, ki veže RNK.
Spodnja infografika prikazuje razlike med faktorjem sigma in faktorjem rho v obliki tabele za vzporedno primerjavo.
Povzetek – faktor Sigma proti faktorju Rho
Transkripcija je proces, pri katerem se informacije v DNK kopirajo v novo molekulo, imenovano mRNA (messenger RNA). Ta m-RNA je končno vključena v proizvodnjo specifičnega proteina. Faktor sigma in faktor rho sta dva pomembna dejavnika za bakterijsko prepisovanje. So beljakovine. Sigma faktor sodeluje pri iniciaciji transkripcije v bakterijah. Rho faktor je odgovoren za prekinitev transkripcije v bakterijah. To je torej povzetek razlike med sigma faktorjem in rho faktorjem.
