Kakšna je razlika med jedrom RNA polimeraze in holoencimom

2024 Avtor: Alex Aldridge | [email protected]. Nazadnje spremenjeno: 2023-12-17 13:49

Ključna razlika med jedrom RNA polimeraze in holoencimom je, da je jedro RNA polimeraze encim, ki nima sigma faktorja, medtem ko je holoencim RNA polimeraze encim, ki je sestavljen iz sigma faktorja.

Transkripcija pri bakterijah je proces, pri katerem se segment bakterijske DNA prekopira v novo sintetizirano verigo mRNA z uporabo encima RNA polimeraze. Ta proces poteka v treh glavnih korakih: začetek, raztezek in zaključek. Bakterijska RNA polimeraza je sestavljena iz 6 podenot. Jedro RNA polimeraze je sestavljeno iz podenot β, β', α2 in ω. To jedro RNA polimeraze se spremeni v holoencim, ko je faktor σ (sigma) vezan na jedrni encim. Jedro RNA polimeraze in holoencim sta dve obliki encima bakterijske RNA polimeraze.

Kaj je RNA Polymerase Core?

RNA polimerazno jedro je encim, ki sodeluje pri bakterijski transkripciji in je brez sigma faktorja. Sestavljen je iz 5 podenot, označenih kot β, β', α2 in ω. Ta encim ne sproži specifične transkripcije iz promotorjev DNA bakterij in fagov. To je zato, ker ne prepozna nobenih specifičnih promotorjev DNK bakterij ali fagov. Vendar pa ta encim ohrani sposobnost prepisovanja RNA iz nespecifičnih iniciacijskih sekvenc. Poleg tega dodatek sigma faktorja temu encimu omogoči, da encim sproži sintezo RNA iz specifičnih bakterijskih in fagnih promotorjev. Molekulska masa jedrnega encima RNA polimeraze je približno 400 kDa.

Slika 01: Jedro RNA polimeraze

Jedrni encim vsebuje katalitične lastnosti RNA polimeraze. Podenota α je homodimer, ki je velik 36,5 kDa. Kodiran je z genom rpoA. Funkcije te podenote so sestavljanje RNAP, interakcije z DNA in transkripcijski faktorji za regulacijo transkripcije. Podenota Β je velika 150,4 kDa. Kodiran je z genom rpoB. Funkcije te podenote so vezava DNA in RNA, sinteza RNA, vezava NTP, mesto vezave RMP in vezava faktorja σ. Podenota β' je velika 155 kDa in jo kodira gen rpoC. Funkcije te podenote so vezava DNA, sinteza RNA, katalitična Mg^{2+ koordinacija, ppGpp vezavno mesto 1 in vezava faktorja σ. Poleg tega je faktor ω velik 10, 2 kDa in ga kodira gen rpoZ. Funkcija faktorja ω je zvijanje RNAP in vezavno mesto ppGpp 1.}

Kaj je RNA polimeraza holoencim?

Holoencim RNA polimeraza je sestavljen iz specifične komponente, znane kot sigma faktor, razen podenot β, β', α2 in ω. Zaradi faktorja sigma lahko holoencim RNA polimeraza prepozna promotorje. Faktor sigma prav tako pomaga pri pravilni postavitvi holoencima RNA polimeraze in odvijanju na začetnem mestu. Ko faktor sigma opravi svojo zahtevano in specifično funkcijo, se loči od holoencima RNA polimeraze, medtem ko katalitični del (β, β', α2 in ω) RNA polimeraze ostane v DNA in nadaljuje s transkripcijo.

Slika 02: RNA polimeraza holoencim

Število sigma faktorjev se razlikuje med vrstami bakterij. E. coli ima sedem sigma faktorjev. Poleg tega se sigma faktorji razlikujejo po svojih značilnih molekulskih masah. Na primer, σ⁷⁰ je sigma faktor z molekulsko maso 70 kDa. Bakterije v različnih okoljskih pogojih uporabljajo različne sigma faktorje. Primeri različnih faktorjev σ vključujejo; σ¹⁹, σ²⁴, σ¹⁸, σ³², σ³⁸ in σ⁵⁴

Kakšne so podobnosti med jedrom RNA polimeraze in holoencimom?

• jedro RNA polimeraze in holoencim sta dve obliki encima bakterijske RNA polimeraze.
• Obe obliki sodelujeta pri bakterijskem prepisovanju.
• Imajo podenote.
• So beljakovinske molekule, sestavljene iz aminokislin.

Kakšna je razlika med jedrom RNK polimeraze in holoencimom?

RNA polimeraza jedro je encim, ki nima sigma faktorja, medtem ko je RNA polimeraza holoencim encim, ki je sestavljen iz sigma faktorja. Tako je to ključna razlika med jedrom RNA polimeraze in holoencimom. Poleg tega jedro RNA polimeraze večinoma sodeluje v koraku elongacije transkripcije, medtem ko holoencim RNA polimeraze večinoma katalizira v iniciacijskem koraku transkripcije.

Spodnja infografika predstavlja razlike med jedrom RNA polimeraze in holoencimom v obliki tabele za vzporedno primerjavo.

Povzetek – RNK polimerazno jedro proti holoencimu

Bakterijska RNA polimeraza je encim, odvisen od več podenot DNA. Sodeluje pri prepisovanju bakterij. Je ključni encim izražanja genov in tarča regulacije. Jedro RNA polimeraze in holoencim sta dve obliki encima bakterijske RNA polimeraze. Jedro RNA polimeraze nima sigma faktorja, medtem ko je holoencim RNA polimeraze sestavljen iz sigma faktorja. Torej, to povzema razliko med jedrom RNA polimeraze in holoencimom.