Ključna razlika med usklajenim in zaporednim modelom alosterizma je, da so pri usklajenem načinu encimske podenote povezane tako, da se konformacijska sprememba v eni podenoti nujno prenese na vse druge podenote, medtem ko so pri zaporednem modelu podenote niso povezani tako, da konformacijska sprememba v eni podenoti povzroči podobno spremembo v drugih.
Usklajeni model in zaporedni model alosterizma lahko opišemo kot dva glavna modela obnašanja alosteričnih encimov. Ti modeli so bili predstavljeni leta 1965 oziroma 1966. Trenutno uporabljamo oba modela kot osnovo za interpretacijo eksperimentalnih rezultatov. Usklajeni model ima to prednost, da je sorazmerno preprost in zelo dobro opisuje obnašanje nekaterih encimskih sistemov. Zaporedni model na drugi strani kaže določeno mero preprostosti, vendar le za nekatere realne slike struktur in obnašanja proteinov. Ta način se zelo dobro ukvarja tudi z obnašanjem nekaterih encimskih sistemov.
Kaj je usklajeni model alosterizma?
Usklajeni model alosterizma predpostavlja, da so encimske podenote povezane na način, pri katerem se konformacijska sprememba v eni podenoti nujno prenese na vse druge podenote. To je znano tudi kot model simetrije ali model MWC. V skladu s tem modelom morajo vse podenote obstajati v isti konformaciji.
Slika 01: Alosterična regulacija (A – aktivno mesto B – alosterično mesto C – substrat D – zaviralec E – encim)
Ta model so predstavili Jacques Monod, Jeffries Wyman in Jean-Pierre leta 1965. Po tem modelu ima protein dve konformaciji: aktivno konformacijo R in neaktivno konformacijo T. Konformacija R tesno veže substrat, medtem ko, v konformaciji T je substrat manj tesno vezan.
Ena značilnost usklajenega modela je, da se konformacija vseh podenot spreminja hkrati. Na primer, v hipotetični beljakovini, ki ima dve podenoti, lahko obe podenoti spremenita konformacijo iz neaktivne T konformacije v aktivno R konformacijo.
Kaj je sekvenčni model alosterizma?
Sekvenčni model alosterizma je mogoče opisati kot neposredni sekvenčni model alosteričnega obnašanja. Ta model ima posebnost, da veže substrat, ki inducira konformacijsko spremembo iz oblike T v obliko R. To je vodilo do oblikovanja kooperativnega veznega izraza tega modela.
Slika 02: Zaporedni model
Poleg tega so v tem modelu vsi aktivatorji in zaviralci vezani z mehanizmom induciranega prileganja. Pri tem konformacijska sprememba inhibitorja ali aktivatorja v eni od podenot vpliva na konformacije drugih podenot.
Najpomembnejše značilnosti sekvenčnega modela vključujejo: ni treba, da njegove podenote obstajajo v isti konformaciji, njegove konformacijske spremembe niso dodeljene vsem podenotam in molekule substratov se vežejo prek protokola induciranega prileganja.
Kakšna je razlika med usklajenim in zaporednim modelom alosterizma?
Ključna razlika med usklajenim in zaporednim modelom alosterizma je v tem, da se pri usklajenem načinu konformacijska sprememba ene podenote nujno prenese na vse druge podenote, medtem ko se pri zaporednem modelu konformacijska sprememba ene podenote ne povzroči podobno spremembo pri drugih.
Povzetek – Usklajeni proti zaporednemu modelu alosterizma
Usklajeni model alosterizma je model, ki predpostavlja, da so encimske podenote povezane na način, pri katerem se konformacijska sprememba v eni podenoti nujno prenese na vse druge podenote. Zaporedni model alosterizma je neposreden zaporedni model alosteričnega obnašanja. V tem modelu konformacijska sprememba v eni podenoti ne povzroči podobne spremembe v drugih. To je torej ključna razlika med usklajenim in zaporednim modelom alosterizma.
