Ključna razlika med 1D in 2D gelsko elektroforezo so lastnosti, ki se uporabljajo za ločevanje proteinov pri gelski elektroforezi. 1D gelska elektroforeza ločuje beljakovine samo na podlagi molekulske mase, medtem ko 2D gelska elektroforeza ločuje beljakovine na podlagi njihove izoelektrične točke in molekulske mase.
Ločevanje beljakovin z gelsko elektroforezo je pomembna tehnika za karakterizacijo beljakovin. Beljakovine imajo različne lastnosti; zato je ločevanje bolj zapleteno v primerjavi z ločevanjem DNK z elektroforezo v agaroznem gelu.
Kaj je 1D gel elektroforeza?
1D gelska elektroforeza, znana tudi kot enodimenzionalna gelska elektroforeza, je metoda ločevanja beljakovin na podlagi molekulske mase. Ločevanje beljakovin v glavnem poteka z elektroforezo v poliakrilamidnem gelu. Na podlagi koncepta gelske elektroforeze se molekule ločijo glede na molekulsko maso in naboj.
Zato je treba pred elektroforezo v gelu izvesti obdelavo z natrijevim dodecil sulfatom (SDS), da se beljakovinam zagotovi enakomeren naboj. SDS denaturira beljakovine in zagotavlja enakomeren negativni naboj na beljakovini; ko pride do uporabe električnega polja, proteini migrirajo na pozitivni terminal glede na njihovo molekulsko maso. Tako se pri ločevanju upošteva le ena lastnina. Zato se ta metoda imenuje 1D gelska elektroforeza.
Slika 01: 1D gelska elektroforeza
Med 1D gelsko elektroforezo se proteini ločijo glede na njihovo molekulsko maso. V tem pogledu molekule z manjšo maso migrirajo hitreje v gelu v primerjavi z beljakovinami z visoko molekulsko maso. Tako beljakovine z visoko težo ostanejo blizu vdolbinic.
Kaj je 2D gel elektroforeza?
2D gelska elektroforeza ali dvodimenzionalna gelska elektroforeza loči proteine na podlagi dveh lastnosti. Dve lastnosti sta izoelektrična točka proteina in molekulska masa. Ta metoda ločevanja beljakovin poveča ločljivost ločevanja beljakovin. Izoelektrična točka proteina je odvisna od pH, pri katerem je protein nevtralen.
Slika 02: 2D gelska elektroforeza
Tako lahko pri 2D gelski elektroforezi protein teče na fiksnem gradientu pH v prvi dimenziji. V drugi dimenziji se proteini ločijo z uporabo vertikalne ali horizontalne elektroforeze v poliakrilamidnem gelu. Tako se proteini ločijo glede na njihovo molekulsko maso v drugi dimenziji.
Poleg tega ta metoda gelske elektroforeze poveča ločljivost ločevanja beljakovin. Zato so izločene beljakovine čistejše. Vendar je cena tehnike veliko višja od enodimenzionalne gelske elektroforeze.
Kakšne so podobnosti med 1D in 2D gelsko elektroforezo?
- Obe tehniki ločujeta beljakovine.
- Zato so pomembni pri karakterizaciji beljakovin.
Kakšna je razlika med 1D in 2D gelsko elektroforezo?
Ključna razlika med 1D in 2D gelsko elektroforezo je, da 1D gelska elektroforeza ločuje proteine samo na podlagi molekulske mase, medtem ko 2D gelska elektroforeza ločuje proteine tako na podlagi izoelektrične točke kot molekulske mase. Zaradi te osnovne razlike med 1D in 2D gelsko elektroforezo se razlikujeta tudi ločljivost ločevanja proteinov in cena obeh tehnik.2D gelska elektroforeza kaže visoko ločljivost kot 1D gelska elektroforeza. Vendar je 2D gelska elektroforeza dražja od 1D gelske elektroforeze.
Spodnja infografika povzema razliko med 1D in 2D gelsko elektroforezo.
Povzetek – 1D proti 2D gel elektroforezi
Ločevanje beljakovin je odvisno od številnih dejavnikov. 1D gel elektroforeza ločuje proteine samo na podlagi molekulske mase. Vendar pa dvodimenzionalna ali 2D gelska elektroforeza poveča ločljivost ločevanja beljakovin. Poleg tega 2D gelska elektroforeza loči proteine na podlagi izoelektrične točke in molekulske mase. Zato so ti podatki pomembni za nadaljnjo obdelavo proteinov in na področju proteomike. To je torej povzetek razlike med 1D in 2D gelsko elektroforezo.
