Ključna razlika med homodimerom in heterodimerom je, da je homodimer protein, narejen iz dveh identičnih proteinov, medtem ko je heterodimer protein, narejen iz dveh različnih proteinov.
Beljakovina je biomolekula, sestavljena iz verig aminokislin. Proteinski dimer je kvartarna proteinska struktura, ki nastane iz združitve dveh proteinskih monomerov ali dveh aminokislinskih verig. Na splošno se med seboj vežejo z nekovalentnimi vezmi. Proteinski dimeri so homodimeri ali heterodimeri. Homodimer ima dva enaka proteina, ki sta nekovalentno vezana. Heterodimer ima dva različna proteina, vezana skupaj. Ta interakcija proteinskega dimera je pomembna pri regulaciji in katalizi.
Kaj je homodimer?
Homodimer je vrsta proteinskega dimera, sestavljenega iz dveh enakih monomerov. Monomeri se vežejo z nekovalentnimi vezmi. Na splošno obstaja 18 povprečnih števil H vezi v homodimerih. Poleg tega je korelacijski koeficient med H-vezmi in vmesnimi ostanki v homodimeru 0,85. Poleg tega je največje število vezi H na ostanek na vmesniku homodimera 0,44. Ne samo to, tudi v homodimerih je več medmolekularnih H vezi. Vendar pa je gostota H vezi na ostanek na vmesniku manjša v homodimerih.
Slika 01: Homodimer
Ko obravnavamo primere homodimerov, so RNA razreda 1 homodimeri. V tem homodimerju je protein R1 odgovoren za redukcijo nukleotidov, medtem ko je protein R2 odgovoren za namestitev niza diiron tirozil. Drugi proteinski homodimer je tiroglobulin, ki ga proizvaja ščitnica. Ksantin oksidaza in etanercept sta tudi homodimera beljakovin.
Kaj je heterodimer?
Heterodimer je vrsta proteinskega dimera, sestavljenega iz dveh neidentičnih monomerov. Z drugimi besedami, heterodimer je protein, sestavljen iz dveh različnih proteinskih monomerov. Na splošno obstaja 12 povprečnih števil H vezi v heterodimerih. Poleg tega je korelacijski koeficient med H-vezmi in vmesnimi ostanki v heterodimerju 0,83. Poleg tega je največje število vezi H na ostanek na vmesniku heterodimera 0,65. V primerjavi s homodimeri je v heterodimerih manj medmolekulskih H vezi. Vendar pa je gostota H vezi na ostanek vmesnika večja pri heterodimerih.
Slika 02: Heterodimer
Encim reverzna transkriptaza je heterodimer, sestavljen iz dveh različnih verig aminokislin. Drug primer heterodimera so opioidni receptorji. Poleg tega je tubulin heterodimerni protein.
Kakšne so podobnosti med homodimerom in heterodimerom?
- Homodimer in heterodimer sta dve vrsti beljakovinskih zatemnilnikov.
- Oba imata dva monomera.
- So kvartarne beljakovinske strukture.
- Dimeri so pogosti pri katalizi in regulaciji.
Kakšna je razlika med homodimerom in heterodimerom?
Homodimer je proteinski dimer, sestavljen iz dveh identičnih proteinskih monomerov, medtem ko je heterodimer proteinski dimer, sestavljen iz dveh različnih proteinskih monomerov. Torej, to je ključna razlika med homodimerjem in heterodimerjem. Poleg tega je v homodimerih 18 povprečnih števil H vezi, medtem ko je v heterodimerih 12 povprečnih števil H vezi.
Poleg tega je druga razlika med homodimerom in heterodimerom ta, da je korelacijski koeficient med H-vezmi in ostanki vmesnika 0,85 pri homodimerih, medtem ko je 0,83 pri heterodimerih.
Spodnja infografika o razlikah med homodimerom in heterodimerjem prikazuje več primerjav med obema dimerjema.
Povzetek – Homodimer vs Heterodimer
Proteinski dimeri so pogosti pri katalizi in regulaciji. Lahko so homodimeri ali heterodimeri. Homodimeri so sestavljeni iz dveh enakih proteinskih monomerov. Nasprotno pa so heterodimeri sestavljeni iz dveh neidentičnih proteinskih monomerov. To je torej ključna razlika med homodimerom in heterodimerjem.
