Ključna razlika med sestavljenimi transpozoni in elementi IS je, da so sestavljeni transpozoni vrsta transpozonov, ki nosijo pomožne gene, kot so geni za odpornost na antibiotike, medtem ko so elementi IS (ali elementi vstavitvenega zaporedja) prenosljivi elementi, ki nosijo samo gene, ki kodna transpozaza, ki katalizira aktivnost transpozicije.
Transpozon je fragment DNK, ki lahko spremeni svoj položaj znotraj bakterijskega genoma. Zato so mobilne sekvence DNK. Premikajo se na nove lokacije genoma, spreminjajo zaporedje bakterijskega genoma in povzročajo pomembne spremembe v genetskih informacijah. Transpozoni so znani tudi kot skakajoči geni, saj lahko blokirajo prepisovanje genov in preuredijo genetski material bakterije. Poleg tega so odgovorni za gibanje genov za odpornost na zdravila, odpornost na antibiotike med plazmidi in kromosomi. Sestavljeni transpozoni in elementi IS sta dve vrsti mobilnih genetskih elementov, ki jih najdemo v bakterijah. Oba se lahko premikata z ene lokacije na drugo v genomu.
Kaj so sestavljeni transpozoni?
Sestavljeni transpozon je segment DNK, obdan z dvema kopijama podobnih elementov vstavitvenega zaporedja. V sestavljenem transpozonu je osrednja regija, ki kodira beljakovine. Geni so pogosto geni, odporni na antibiotike. Lahko vsebujejo tudi katabolične gene. Poleg tega je sestavljeni transpozon sestavljen iz dveh obrnjenih ponovitev. Celotna dolžina sestavljenega transpozona se premika kot ena celotna enota.
Slika 01: Kompozitni transpozon
Tn10 je sestavljen transpozon. Sestavljen je iz 6,5 kb velike centralne kodirne regije (tetraciklin odporen gen) in 1,4 kb invertiranih elementov insercijske sekvence na vsakem koncu. Elementi IS zagotavljajo transpozazo. Transpozaza je encim, ki katalizira gibanje transpozona. Sestavljene transpozone je mogoče pomnožiti in oblikovati primerje za elemente IS.
Kaj so elementi IS?
Elementi zaporedja vstavljanja ali elementi IS so vrsta mobilnega genetskega elementa. So preprosta oblika transpozonov. Nosijo le gene, ki kodirajo encime transpozaze. Encimi transpozaze katalizirajo prenos transpozonov. Strukturno je kodirno zaporedje elementov IS obdano z dvema obrnjenima ponovitvama. Na primer, element IS, imenovan IS911, je obdan z dvema obrnjenima ponovnima skrajnima točkama 36 bp.
IS elementi so najpogostejši avtonomni prenosljivi elementi v bakterijskem genomu. Zato so izjemno pomembni za organizacijo in evolucijo prokariontskega genoma. Poleg tega se elementi IS pojavljajo kot deli sestavljenih transpozonov. Na splošno najdemo dva elementa IS ob kodirni sekvenci sestavljenega transpozona. Vendar enotni transpozoni ne nosijo bočnih elementov IS.
Ker se elementi IS lahko premikajo znotraj genoma, lahko prekinejo kodirno zaporedje drugih genov in onesposobijo gene z blokiranjem izražanja.
Kakšne so podobnosti med sestavljenimi transpozoni in elementi IS?
- Tako sestavljeni transpozoni kot elementi IS lahko spremenijo položaj v bakterijskem genomu.
- Kodirno območje v obeh transpozonih je običajno obdano z obrnjenimi ponovitvami.
- Sestavljeni transpozon je obdan z dvema ločenima elementoma IS.
Kakšna je razlika med sestavljenimi transpozoni in elementi IS?
Sestavljeni transpozoni so mobilni genetski elementi, sestavljeni iz dveh insercijskih sekvenc (IS), ki pogosto spremljata enega ali več genov za odpornost na antibiotike. Po drugi strani so elementi IS vrsta enostavnega prenosljivega elementa, ki vsebuje gene, ki kodirajo encim transpozazo za kataliziranje prenosa. To je torej ključna razlika med sestavljenimi transpozoni in elementi IS.
Spodaj je seznam razlik med sestavljenimi transpozoni in elementi IS v obliki tabele za vzporedno primerjavo.
Povzetek – Kompozitni transpozoni v primerjavi z elementi IS
Bakterijski genom ima genetske elemente, ki so mobilni. Sestavljeni transpozoni in elementi IS sta dve vrsti mobilnih genetskih elementov. Sestavljeni transpozoni nosijo gene, odporne na antibiotike, in bočne elemente IS. Elementi IS nosijo genetsko kodo za proizvodnjo transpozaze, ki katalizira gibanje transpozonov. To je torej ključna razlika med sestavljenimi transpozoni in elementi IS.
