Ključna razlika med haploskupino in haplotipom je v tem, da se haploskupina nanaša na skupino podobnih haplotipov, ki imajo skupnega prednika, medtem ko se haplotip nanaša na niz alelov, ki se skupaj dedujejo iz generacije v generacijo zaradi genetske povezave.
Gen je sestavljen predvsem iz dveh alelov. V kromosomih je na tisoče genov. Pri ločevanju kažejo križanja in genetske rekombinacije. Nekateri aleli genov pa se nahajajo zelo blizu drug drugega. Preprosto povedano, ti aleli kažejo genetsko povezavo. Zato ni verjetno, da se bodo križali ali rekombinirali. Namesto tega se vedno nagibajo k skupnemu prenosu iz generacije v generacijo. V skladu s tem je haplotip kombinacija alelov ali niza polimorfizmov posameznega nukleotida, prisotnih na istem kromosomu, ki se dedujejo skupaj skozi generacije od enega starša. Haploskupina je skupina podobnih haplotipov, ki imajo skupnega prednika.
Kaj je haploskupina?
Haploskupina je skupina podobnih haplotipov, ki imajo skupnega prednika. Z drugimi besedami, haploskupina je kombinacija alelov, prisotnih v različnih kromosomih, ki se dedujejo skupaj. Ti aleli so prisotni zelo blizu drug drugega. Haplotipi v haploskupini imajo podobne vzorce in so sorodni potomci, saj imajo skupnega prednika. Tako je iz haplotipov enostavno napovedati haploskupino.
Slika 01: Haploskupina
Pri človeku obstajata dve najpogostejši haploskupini. To so haploskupine kromosoma Y, ki prehajajo z očeta na sina, medtem ko haploskupine mitohondrijske DNK prehajajo z matere na hčerko ali sina.
Kaj je haplotip?
Haplotip je skupek alelov, ki se dedujejo skupaj. Ti aleli so prisotni v istem kromosomu zelo blizu drug drugemu zaradi genetske povezave. Zato ni možnosti za rekombinacijo ali križanje. Zato skupaj prehajajo iz roda v rod. Ti aleli so lahko aleli enega gena ali aleli več genov. Haplotip se lahko nanaša tudi na skupino polimorfizmov enega nukleotida, prisotnih na istem kromosomu. Torej so skupek variacij DNK ali polimorfizmov, podedovanih skupaj.
Slika 02: Polimorfizem enega nukleotida
Informacije o haplotipih so uporabne pri raziskovanju vpliva genov na bolezni. Z analizo haplotipov in haplotipskih dreves lahko genetiki odkrijejo z boleznijo povezane regije genoma in določijo vzorce genetskih variacij, povezanih z boleznimi. Poleg tega so uporabni pri kartiranju genov, ko postavljajo genetske markerje na prava mesta na kromosomih.
Kakšne so podobnosti med haploskupino in haplotipom?
- Haploskupina je sestavljena iz podobnih haplotipov.
- Kažejo genetske povezave.
- Križanja ali genetske rekombinacije v haplotipih in haploskupinah ni.
Kakšna je razlika med haploskupino in haplotipom?
Haploskupina je kombinacija alelov, prisotnih v različnih kromosomih, ki se dedujejo skupaj. Sestavljen je iz podobnih haplotipov, ki imajo skupnega prednika. Po drugi strani pa je haplotip niz alelov, ki jih najdemo v istem kromosomu in se dedujejo skupaj skozi generacije. To je torej ključna razlika med haploskupino in haplotipom.
Spodnja infografika povzema razliko med haploskupino in haplotipom.
Povzetek – haploskupina proti haplotipu
Haploskupina je skupina podobnih haplotipov, ki imajo skupnega prednika. Po drugi strani pa je haplotip kombinacija alelov ali niza polimorfizmov enega nukleotida, prisotnih na istem kromosomu, ki se prenašajo iz generacije v generacijo od enega starša. Zato je to ključna razlika med haploskupino in haplotipom. Haplotipi zagotavljajo enostaven način za napovedovanje haploskupin, saj je haploskupina sestavljena iz podobnih haplotipov.
