Peptid proti beljakovinam
Aminokisline, peptidi in proteini se pogosto imenujejo sorodni izrazi, vendar se razlikujejo po svojih značilnostih. Aminokisline so gradniki tako peptidov kot beljakovin. Aminokislina je majhna molekula, ki vsebuje amino skupino (-NH2) in skupino karboksilne kisline (-COOH), ki sta vezani na osrednji ogljikov atom, z dodatnim vodikom in stransko verigo (R-skupina). Ta stranska veriga se med vsemi aminokislinami razlikuje; zato določa edinstvene lastnosti in kemijo vsake aminokisline. Za določitev aminokislinskega zaporedja v peptidih in beljakovinah se uporablja določeno gensko zaporedje.
Peptid
Peptidi so sestavljeni iz dveh ali več aminokislin, ki so povezane s peptidnimi vezmi in so prisotne kot linearne verige. Dolžina peptida je določena s količino aminokislin v njem. Običajno je dolžina peptida manjša od približno 100 aminokislin.
Predpone se uporabljajo za opis vrste peptidov v splošni terminologiji. Na primer, ko je peptid sestavljen iz dveh aminokislin, se imenuje dipeptid. Tako se tri aminokisline združijo, da nastanejo tripeptidi, štiri aminokisline se združijo, da nastanejo tetrapeptidi itd. Poleg teh vrst obstajajo oligopeptidi (sestavljeni iz 2-20 aminokislin) in polipeptidi, ki imajo veliko peptidov (manj kot 100). Najpomembnejše značilne lastnosti peptidov določata količina in zaporedje aminokislin.
Primarna funkcija večine peptidov je omogočiti učinkovito komunikacijo s prenašanjem biokemičnih sporočil z enega mesta na drugega v telesu.
Beljakovine
Beljakovine so najbolj raznolika skupina bioloških makromolekul. Beljakovine so sestavljene iz ene ali več dolgih nerazvejanih verig, imenovanih polipeptidi, vendar so gradniki beljakovin aminokisline. Zaporedje aminokislin določa glavne značilnosti proteina, medtem ko je to zaporedje aminokislin definirano s posebnim genskim zaporedjem.
Običajno imajo proteini stabilne tridimenzionalne strukture. O teh strukturah je mogoče razpravljati v smislu hierarhije štirih ravni; primarni, sekundarni, terciarni in kvartarni. Primarna struktura je aminokislinsko zaporedje beljakovine. Sekundarna struktura nastane z tvorbo vodikovih vezi med dvema bližnjima aminokislinama, kar povzroči strukture, imenovane β-prevlečene plošče, in tuljave, imenovane α-vijačnice. Področja sekundarne strukture se nato prepognejo naprej v prostoru, da se oblikujejo končne tridimenzionalne strukture proteina. Razporeditev več polipeptidov v prostoru povzroči kvarterno strukturo proteina.
Glavne funkcije beljakovin so encimska kataliza, obramba, transport, podpora, gibanje, regulacija in shranjevanje.
Kakšna je razlika med peptidom in beljakovinami?
• Peptidi so kratke linearne verige aminokislin, medtem ko so proteini zelo dolge verige aminokislin.
• Več aminokislin je povezanih skupaj, da tvorijo peptid s peptidnimi vezmi, medtem ko je več peptidov povezanih skupaj, da tvorijo beljakovinske molekule.
• Običajno imajo proteini stabilne tridimenzionalne strukture. Nasprotno pa peptidi niso organizirani v stabilno tridimenzionalno strukturo.
• Dolžina peptida je manjša od približno 100 aminokislin, medtem ko je dolžina proteina več kot 100 aminokislin. (Obstajajo izjeme; zato so razlike bolj odvisne od delovanja molekul kot od njihove velikosti)
• Za razliko od peptidov se proteini obravnavajo kot makromolekule.
• V peptidih le stranske verige aminokislin tvorijo vodikove vezi. Medtem ko pri beljakovinah vodikove vezi ne tvorijo samo stranske verige, ampak tudi peptidne skupine. Te vodikove vezi so lahko z vodo ali z drugimi peptidnimi skupinami.
• Vsi peptidi obstajajo kot linearne verige, medtem ko lahko proteini obstajajo kot primarni, sekundarni, terciarni in kvartarni.
